¿Qué es la biología matemática y cómo se usa?

En resumen, la biología matemática es la disciplina que se centra principalmente en el modelado ( en oposición a la inferencia) de procesos biológicos, y nos informa sobre los principios básicos que los rigen.

A menudo se basa en técnicas de sistemas dinámicos, teoría de juegos, procesos estocásticos, análisis espacial, teoría de redes, física estadística y, más recientemente, informática teórica.

El objeto de interés son a menudo poblaciones de entidades que evolucionan (por ejemplo, estudiar sistemas basados ​​en el modelo de Moran).

Como la mayoría de las áreas de la ciencia, es difícil definir límites precisos. Pero aquí hay algunos documentos desde diferentes perspectivas que podrían considerarse “biología matemática”:

  • Aquí hay un artículo clásico de Alan Turing: http://www.dna.caltech.edu/cours…
  • Una revisión de la biología matemática, ya que informa el tratamiento del cáncer. Resistencia a la resistencia. La afirmación de “caso de uso” se hace en abstracto:
    • “Sin embargo, es posible desarrollar una comprensión matemática precisa del problema y diseñar estrategias de tratamiento que eviten la resistencia”
  • “Infotaxis”, un modelo de búsqueda bacteriana donde el agente tiene que encontrar la fuente sin el uso de un gradiente continuo. En este caso, los autores sugieren que podría usarse para diseñar robots olfativos. Esto se basa en la teoría de la información. https://www.nature.com/nature/jo…
  • Aquí hay un documento más abstracto (con aplicaciones menos directas) que trata con dinámicas cooperativas restringidas a una superficie 2D. Tiene usos para comprender muchos procesos biológicos (incluida la cooperación humana, las interacciones huésped-parásito, el origen de la vida y el cáncer). Esto se basa en sistemas dinámicos y el caos. https://www.stat.berkeley.edu/~a…
  • “Algoritmo de actualizaciones de peso multiplicativo” como modelo de cómo los procesos evolutivos buscan en un paisaje de fitness. Una vez más, no necesariamente es una idea directa “aplicada”, sino bastante útil para comprender lo que hace la evolución. Este artículo utiliza un poco de teoría CS. Algoritmos, juegos y evolución.
  • Aquí hay un artículo más “técnico / teórico” sobre genética de poblaciones Dinámica evolutiva en el modelo de dos alelos de dos locus con selección débil. Esto podría ser útil para decir experimentos en moscas de la fruta (cómo se espera que cambien las combinaciones de genes en una población).

La biología matemática es el campo científico que intenta modelar sujetos biológicos utilizando las matemáticas.

Ejemplo: La teoría de juegos es una rama de las matemáticas que modela las diferentes estrategias y cómo “ganar” en una situación muy específica (llamada “juego”). En biología matemática, la teoría de juegos se utiliza para examinar las estrategias de comportamiento de los animales y cómo podrían evolucionar.

Ejemplo: cuando los biólogos descubren una importante red de genes (es decir, un conjunto de genes que alteran la expresión de los demás, presentando un comportamiento complejo de autorregulación), un biólogo matemático puede utilizar la teoría de los sistemas dinámicos y la bifurcación para explicar cómo se comporta la red en diferentes ambientes

La biología matemática tiene una superposición con la biología computacional, ya que los modelos matemáticos a menudo se complementan con computación avanzada y aprendizaje automático.

Se aplicaron cálculos en biología, pero tendrías que pedirle a los biólogos mejores ideas