¿Cómo interactúa una proteína con otra proteína?

Las proteínas se unen entre sí mediante una combinación de enlaces hidrófobos, fuerzas de van der Waals y puentes salinos en dominios de unión específicos en cada proteína. Estos dominios pueden ser pequeñas hendiduras de unión o grandes superficies y pueden tener solo unos pocos péptidos de largo o abarcar cientos de aminoácidos, y la fuerza de la unión está influenciada por el tamaño del dominio de unión.

Las proteínas tienen dominios estructurales que permiten su interacción y se unen a secuencias específicas en otras proteínas, como el dominio de homología Src 2 (SH2), el dominio de homología Src 3 (SH3), el dominio de unión a fosfotirosina (PTB) . Puede consultar este enlace para obtener más información: interacción proteína-proteína – Wikipedia

Para los métodos de detección de interacción proteína proteína, quizás el siguiente enlace pueda ayudarlo:

Métodos para la detección de interacciones proteína-proteína

De la misma manera que interactúan dos moléculas: enlaces de hidrógeno, fuerzas de van der Waals, a veces enlaces covalentes, reacciones (en sitios activos de enzimas), enlaces iónicos, cambios conformacionales en una o ambas estructuras de proteínas.

de la misma manera que se une a través de enlaces H, enlaces hidrofóbicos, interacción de Van der Waals, los enlaces disulfuro en la cisteína …