¿Qué es Sense Strand DNA y cuál es su relevancia?

He estado estudiando Bioquímica / Mol Bio el tiempo suficiente como para haber visto cambiar el significado de un capítulo a otro. En la “edad oscura” cuando era estudiante universitario (hace 50 años), la “cadena sensorial” significaba la cadena que produciría un producto de ARN correcto. No teníamos secuenciación de ADN en ese entonces, por lo que la terminología parecía precisa, la cadena de sentido “funcionó” y la otra cadena no.

Una vez que la secuenciación del ADN se hizo común, la definición cambió de una hebra a la otra. Debido a que podía “ver” las 2 cadenas, la cadena sensorial se convirtió en la cadena que parecía el producto de ARN en lugar de la cadena que producía el producto de ARN. Es por eso que generalmente me quedo con la terminología (+) y (-) en lugar de “sentido” y “antisentido”.

Odio cuando la terminología hace que sea MÁS DIFÍCIL entender algo en lugar de ser más fácil. En cualquier caso, cuando lees sobre cosas como el sitio del promotor en el ADN que atrae a la ARN polimerasa, las secuencias dadas para las secuencias –35 y –10 son siempre de la cadena (+) (TATAAT para bacterias y la caja TATA para eucariotas). En realidad, esto dice “¡ESTA ES LA HILA INCORRECTA!”, La ARN polimerasa necesita usar la OTRA cadena (la cadena negativa) como plantilla.

Hebras de ADN