¿Qué técnica tiene menos errores, PCR o clonación de ADN? ¿Cuáles son las posibles fuentes de estos errores?

Hmm Es difícil responder sin más detalles … en parte porque es posible que no estés usando la terminología correcta (o al menos, no la misma terminología en la que estoy pensando 🙂)

Entonces, normalmente en un proceso de clonación, la PCR se usa como un paso. Cuando yo (de un laboratorio de células bacterianas / de mamíferos) pienso en la clonación, estoy pensando en tomar un tramo de ADN que debe insertarse en una célula, transformarlo / transfectarlo en la célula y luego clonar la colonia lo suficientemente grande como para recoger una gran muestra de ADN de vuelta.
Vector de clonación – Wikipedia

Para hacer esto, el primer paso es usar PCR con adaptadores que han sido diseñados, para generar los insertos, que entran en ‘vectores’, que luego se transforman / transfectan en la célula. Por lo general, también hay un paso de ligadura allí … donde tomas tu inserto corto y generado, y usas la enzima DNA-lygase cosechada para unirlos en un plásmido grande.

PCR: pasos involucrados en la reacción en cadena de la polimerasa – Transcripción del video y la lección | Study.com

Vector de clonación – Wikipedia

¿Cuál es la diferencia entre transformación y transfección?

Ligadura (biología molecular) – Wikipedia

Si está pensando en usar la PCR para generar mucho ADN, en comparación con la clonación para generar mucho ADN … depende de sus objetivos finales.

La PCR solo puede generar secuencias cortas de ADN. Si bien está mejorando cuánto tiempo puede reproducirse una cadena, todavía está muy, muy lejos de ser capaz de generar los pequeños cromosomas bacterianos, sin mencionar ninguna longitud de ADN humano de interés.

Cromosoma bacteriano circular – Wikipedia

Entonces, si está tratando de crear un pequeño tramo de ADN (como un inserto de plásmido), la PCR es todo lo que necesita. Para cualquier cosa más larga, debe comenzar con la PCR y terminar con la clonación.

EDITAR:
Sin embargo, para responder a su pregunta original, en términos demasiado simplificados …

La clonación “probablemente” genera menos errores, ya que la mayoría de las células (ciertamente todas las células de mamíferos) tienen mecanismos de verificación de errores que corrigen errores en la replicación del ADN. Esta es la base de generar ADN a través de la clonación (replicación de ADN y luego recolección).

Esto también depende del tipo de material genético y del tipo de célula. Por ejemplo, el ADN plasmídico en las bacterias a menudo simplemente se destruye, o incluso se ignora, cuando se detectan errores … ya que los plásmidos pueden pasar (relativamente) libremente entre llamadas bacterianas.

El ARN también se degrada (generalmente) simplemente cuando se detectan errores significativos. El ARNm es un material temporal de todos modos.

ETC.

plásmido / plásmidos

Depende de cómo esté clonando y de la fidelidad de la polimerasa que esté usando. Si usa polimerasa de alta fidelidad, debería tener muy pocos errores. Si está clonando por digestión con enzimas de restricción sin amplificación, no debería (en teoría) introducir mutaciones en su secuencia. ¡Es por eso que siempre debe tener siempre sus clones secuenciados después de clonarlos! La fuente del error en la amplificación por PCR suele ser con la polimerasa, a menos que se haya producido un daño en la secuencia antes de la amplificación. En la clonación, puede dañar su inserto si se deja demasiado tiempo bajo la luz UV mientras lo purifica, si no amplifica su inserto con polimerasa de alta fidelidad o si de alguna manera introduce errores con los cebadores.