Cada relación entre un término GO y un gen está etiquetada con evidencia de apoyo. Esto se divide en 5 categorías amplias, cada una con códigos de evidencia más detallados.
Evidencia experimental
Esto significa que un artículo publicado cita un experimento que muestra que el gen en cuestión es relevante para ese término funcional GO
- Inferido del experimento (EXP)
- Inferido del ensayo directo (IDA)
- Inferido de la interacción física (IPI)
- Inferido del fenotipo mutante (IMP)
- Inferido de la interacción genética (IGI)
- Inferido del patrón de expresión (IEP)
Análisis computacional
En este caso, la asignación se realizó sobre la base del análisis de secuencia u otros métodos computacionales.
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- Inferido de secuencia o similitud estructural (ISS)
- Inferido de la Secuencia de Ortología (ISO)
- Inferido de la alineación de secuencia (ISA)
- Inferido del modelo de secuencia (ISM)
- Inferido del contexto genómico (IGC)
- Inferido del aspecto biológico del antepasado (IBA)
- Inferido del aspecto biológico del descendiente (EII)
- Inferido de Residuos Clave (IKR)
- Inferido de la divergencia rápida (IRD)
- Inferido del Análisis Computacional Revisado (RCA)
Declaración del autor
Esto significa aproximadamente que alguien ha publicado esta relación, pero no cae en los grupos experimentales o computacionales.
- Declaración de autor rastreable (TAS)
- Declaración de autor no rastreable (NAS)
Declaración curatorial
Incluso un poco más vago, esto significa que no se ha publicado en ninguna parte, pero los curadores “pueden inferir razonablemente que existe una relación”
- Inferido por el curador (IC)
- No hay datos biológicos disponibles (ND) código de evidencia
Asignado automáticamente
Estas son anotaciones que se han generado computacionalmente, pero no revisadas por un curador. Las anotaciones permanecen en esta categoría durante un máximo de un año, momento en el que se revisan o eliminan.
- Inferido de la anotación electrónica (IEA)
Fuente: Guía de códigos de evidencia GO
