¿Cómo elige la ARN polimerasa su cadena de ADN para transcribir?

Además de lo escrito por Alex Robertson hasta ahora, me gustaría agregar los procariotas (pero en los eucariotas es probable que ocurra algo así también), la ARN polimerasa puede unirse a ambas cadenas. Ahora, se encontró que en muchos casos el 5′-3 ′ transcribe para el ARNm, digamos A , la cadena opuesta que se está trasncribiendo no es completamente opuesta a la 5′-3 ′ (de lo contrario, obtendría el antisentido, por lo que interferencia) pero se encuentra un poco decaído o corriente superior y el ARNm resultante vamos a A2 funciona como un ARN interferente contra un ARNm B (transbribrado en otro lugar a lo largo del ADN) cuya proteína puede inhibir la función de la transbribda por el ARNm A!

Por lo tanto, ambas cadenas son necesarias para asegurar la función de ese ARNm específico.

Este fenómeno recibió su nombre de la Teoría de la exclusión y se observó en Lysteria monocytogenes: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc…

Recientemente se ha descubierto que las ARN polimerasas en realidad comienzan a transcribir ambas cadenas de ADN de manera divergente en lo que se denomina transcripción bidireccional divergente. Esto ocurre en

Después del inicio de la transcripción, ciertos determinantes de secuencia distribuidos asimétricamente provocan que la transcripción en la dirección antisentido termine y que la transcripción en sentido (correcto) continúe productivamente.

Más específicamente, los sitios de empalme U1 en la dirección de sentido (del promotor) protegen la cadena naciente de la escisión. Los sitios de poliadenilación en la cadena antisentido hacen que se corte.

Se presume que esta transcripción divergente mantiene el gen “preparado” para una mayor transcripción.

Una descripción completa de cómo funciona esto está aquí:
http://www.nature.com/nature/jou
(disculpas por el paywall)

  1. La cadena de ADN molde tiene una secuencia promotora tanto en prok como en euk.

2. En prok, la subunidad sigma de RNA pol reconoce el promotor seq (cuadro Pribnow).

3. En euk, Promotor seq es reconocido por los factores de iniciación de la transcripción y otros factores de transcripción.

4. Los factores de iniciación de la transcripción, es decir, TFIID reconoce la caja TATA, TFIIB dobla el ADN, TFIIB y TFIIF facilita el posicionamiento correcto del ARN pol II.

5. Hasta y a menos que la ARN polimerasa no obtenga una señal para la síntesis, es decir, la fosforilación del dominio C-terminal, no comienza el alargamiento.

Creo que esa cadena tiene la secuencia promotora. No leerá desde el otro lado