El SDS o dodecil sulfato de sodio y también llamado laurilsulfato de sodio es un detergente aniónico utilizado en preparaciones de ADN de bacterias, animales y, a veces, plantas. La acción principal de SDS es la alteración de las estructuras lipídicas en la membrana celular y, por lo tanto, se utiliza para la disrupción celular. SDS también desnaturaliza las proteínas e inactiva muchas enzimas que degradan el ADN (DNasa) y algunas enzimas que degradan el ARN (RNasa). Esto asegura que a medida que las membranas celulares, incluidas las membranas de los orgánulos, se rompen, el ADN está a salvo de las enzimas degradantes liberadas.
Durante el método de lisis alcalina de preparación de ADN plasmídico a partir de bacterias, se agrega SDS en combinación con una solución alcalina de NaOH después de que las células se suspenden en tampón de suspensión. El SDS rompe las membranas celulares y rompe el enlace no covalente en las moléculas de proteínas al unirse con ellas con alta afinidad. Este complejo de proteína SDS forma un complejo insoluble en el siguiente paso cuando se agrega una solución de renaturalización de acetato de potasio 3M. El complejo K + -SDS-proteína forma grupos que ayudan a enredar el ADN genómico y toda la impureza de las proteínas y el ADN genómico, ahora en forma insoluble, pueden eliminarse por centrifugación simple dejando solo el ARN y el ADN plasmídico en el sobrenadante.
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