¿Cuál es el significado de especificar que se usó ‘ARN de horquilla corta’ en los experimentos?

Sería útil saber exactamente qué has leído, pero shRNA como siRNA se usa para silenciar la expresión génica a través de la interferencia de ARN. No se refieren a las transcripciones (ARNm), supongo. Entonces, cuando transfecta shRNA en una línea celular, la expresión génica correspondiente al shRNA específico utilizado se elimina.

La horquilla significa que el ARN se pliega sobre sí mismo, creando ARN bicatenario. Esto se corta en pequeños fragmentos y se carga en el complejo de silenciamiento inducido por ARN donde una proteína llamada argonauta lleva estos pequeños fragmentos como ARN guía, a diferencia de Cas9. Esto significa que el ARNm nativo de un gen de interés se corta antes de que llegue al ribosoma, si se usó un segmento de su secuencia de ARNm para cebar el complejo silenciador de ARN. Esto es realmente útil para muchos genes que no pueden ser eliminados porque son esenciales en el desarrollo o algo así.