¿Las cadenas de sentido, cadena no de plantilla, cadena de codificación y cadena plus significan lo mismo?

Algo así como.

Cadena de detección : esta es la cadena transcrita, cuando se habla del ARN antisentido como mecanismo regulador. Si está hablando de PCR, sin embargo, es la cadena correspondiente a uno de los cebadores; el otro cebador es el cebador antisentido.

Cadena de plantilla : la cadena que está siendo procesada por una polimerasa. Durante la replicación del ADN, una cadena es la cadena principal, la otra es la cadena rezagada. Los filamentos iniciales y rezagados son plantillas para diferentes polimerasas. En la transcripción de ADN a ARN, la cadena molde es el complemento inverso del ARN transcrito.

La cadena sin plantilla es la cadena que se hibrida con la cadena de plantilla. La secuencia de ARN transcrita es el ARN equivalente de la cadena no molde en el ADN.

Cadena de codificación : cuando un gen codifica una proteína, el ARN transcrito es la cadena de codificación, y la cadena de ADN equivalente, la cadena no molde, también se denomina cadena de codificación.

Cadena más: hay virus de ARN de cadena más y menos. Creo que la cadena positiva se refiere a la cadena en la que están codificados la mayoría de los genes virales, pero los virus tienen genomas muy compactos y no me sorprendería en absoluto si algunos virus tienen genes codificados en la cadena negativa, genes superpuestos codificados en el más hilo.

Cadena representada: esta es la cadena que encuentras en tu representación del genoma. La convención es para la cadena representada de una secuencia cromosómica que comienza con el brazo corto del cromosoma. Si la secuencia que tiene no es un cromosoma completo, la cadena representada puede ser la misma que la cadena representada del cromosoma, o no; todas las apuestas están cerradas.

Línea superior: Sinceramente, no sé a qué línea se refiere esto. Pienso en la cadena superior como la cadena representada y la cadena inferior como complemento inverso, pero un compañero de trabajo mío argumenta que la cadena inferior corre de 5 ‘a 3’ de izquierda a derecha, y por lo tanto es la cadena representada. Tal vez piensa en la línea superior que corre de derecha a izquierda porque asistió a la escuela de posgrado en Israel, y el hebreo está escrito de derecha a izquierda. No lo sé.

Algunos de nosotros nos referimos a las dos cadenas de ADN como Watson y Crick; cuando hago eso, es en situaciones donde no importa cuál es cuál, solo que hay dos hilos.