¿Es el gen una analogía científica para ‘alma’?

No. Un gen es un objeto físico, una región específica dentro de una cadena de ADN que influye en un rasgo del organismo. No es inmortal, solo difícil de matar porque se puede copiar. Y no es más capaz de existir fuera del cuerpo que otras partes del cuerpo. Puede cultivar un linaje celular de su tejido fuera de su cuerpo. Hay un perro que sobrevivió durante 10,000 años de esta forma en forma de cáncer venéreo infeccioso.

Y las diferencias son enormes. Cada persona tiene aproximadamente 23000 genes (las pulgas de agua tienen más). No puedo pensar en otras similitudes que no sean las enumeradas en la pregunta, que son dudosas. El hecho de que haya algunas similitudes entre dos conceptos no significa que haya una analogía interesante entre ellos. Una analogía debería permitirle hacer algún tipo de conexión no trivial.

Una vez más, recuerdo a Piet Hein:
Ninguna vaca es como un caballo
Y no hay caballo como una vaca.
Esa es una similitud, de todos modos!

Probablemente. Pero, el Alma está relacionada con la religión y Gene es un fenómeno científico. La ciencia nunca aceptará las connotaciones religiosas. Un factor importante es el Multi Tera Bytes / Peta Bytes de datos que la ciencia confirma en el ADN. ¿Puede la ciencia asumir el desafío de reducir las cajas de almacenamiento a tal tamaño? ¿Y mantener los datos intactos durante siglos sin ningún suplemento energético externo?