La estabilidad de la doble hélice del ADN depende de un buen equilibrio de interacciones que incluyen enlaces de hidrógeno entre bases, enlaces de hidrógeno entre bases y moléculas de agua circundantes, e interacciones de apilamiento de bases entre bases adyacentes.
El enlace de hidrógeno entre cadenas es claramente importante para impulsar la formación de cadenas dobles de ADN, pero de ninguna manera es el único factor contribuyente. Las bases individuales forman fuertes interacciones de apilamiento que son los principales contribuyentes a la estabilidad de doble cadena, ya que el apilamiento de bases es mucho más frecuente en cadenas dobles que en cadenas individuales. Las interacciones de apilamiento de bases son de naturaleza hidrofóbica y electrostática, y dependen de la aromaticidad de las bases y sus momentos dipolares. Las interacciones de apilamiento de bases en las cadenas dobles de ácido nucleico son en parte entre cadenas y en parte dentro de cadenas en la naturaleza. Sin embargo, probablemente sea más informativo considerar los pares de bases en lugar de las bases individuales como unidades discretas para visualizar los efectos estabilizadores del apilamiento de bases.
El grado de estabilización proporcionado por el apilamiento de bases depende de la secuencia de ADN. Algunas combinaciones de pares de bases forman interacciones más estables que otras, por lo que las interacciones de apilamiento de bases vecinas más cercanas son determinantes importantes de la estabilidad de la doble cadena de ADN.
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Las interacciones de apilamiento de bases aumentan con el aumento de la concentración de sal, ya que las altas concentraciones de sal enmascaran la repulsión de carga desestabilizadora entre las dos cadenas principales de fosfodiéster con carga negativa. La estabilidad de la doble cadena de ADN, por lo tanto, aumenta al aumentar la concentración de sal. Los cationes divalentes como el Mg2 + son más estabilizadores que los iones Na +, y algunos iones metálicos se unen a loci específicos en el dúplex de ADN.
Espero eso ayude.
