¿Por qué los científicos extraen ARN de las células? ¿Por qué es tan importante la extracción de ARN?

La extracción de ARN y el análisis posterior con técnicas tales como ARN-Seq (secuenciación de ARN) o microarrays le dirá a uno en qué estado funcional estaban las células o, por ejemplo, los tejidos, o cómo trataron de responder a un estrés o estímulo específico. Estas son técnicas ómicas (transcriptómica, para ARN), por lo que pretenden obtener una idea muy paralela de los procesos metabólicos, en este caso las actividades genéticas y los procesos reguladores de micro-ARN (miRNA).

Los ARN extraídos pueden decirnos qué genes se expresan (se usan para fabricar productos), en qué abundancia relativa (cómo se ve el perfil de expresión de los genes / en qué grado están activos), qué ARN de codificación de proteínas o estructurales se generan (ARNm, ARNt y ARNr), y cómo funcionan los genes para regularse entre sí a través de pequeños ARN reguladores.

Por ejemplo, para comprender de qué manera las células específicas respondieron al tratamiento con un medicamento, cómo responden los cánceres al hambre de oxígeno, o el tejido pulmonar a la infección con un virus.

El ADN es el disco duro, por así decirlo. Pero para comprender el programa actualmente activo, extraer y analizar ARN es un buen camino, a menudo irreemplazable.

También quiero agregar, si los científicos en cuestión están especializados en estudiar ARN, solo necesitarán extraerlo para analizarlo en sus experimentos. Es un grupo de moléculas muy interesante. De corta duración, en comparación con el ADN, pero hasta cierto punto autocatalítico (hay enzimas hechas de ARN), codificación de proteínas o codificación sin proteínas, y una parte importante de las redes reguladoras. También se puede empaquetar en exosomas y distribuir a células y tejidos remotos, para colocarlos en un programa relacionado como la célula de origen. Una especie de mensajero remoto de información compleja. Entonces, incluso cuando alguien no está interesado en las técnicas ómicas, comprender la biología básica del ARN o la señalización celular a menudo requiere mucha extracción para hacer experimentos con él, a menos que las moléculas sean lo suficientemente pequeñas como para ser sintetizadas de manera factible.

El ARN se extrae de las células usando un tampón de extracción rico en fenol-tiocianato. Un flujo de trabajo típico consiste en lisar (desgarrar las células de la membrana celular) y luego separar el ARN de la proteína y el ADN y precipitarlo. Usando reactivos como Trizol, la mayoría de estos pasos se pueden realizar directamente en el plato en el que crecen las células. La principal preocupación después de la lisis de las células es mantener un entorno libre de ARNasa en el banco, ya que las ARNasas están presentes prácticamente en todas partes y pueden degradar su ARN en cuestión de minutos.

¿Por qué es importante? Se pueden obtener tres tipos generales de información al estudiar el contenido de ARN de una célula. Primero, qué genes se transcriben en ARN. En segundo lugar, cuántos de estos ARN pueden producir proteínas y viceversa, y cuál es la abundancia relativa de moléculas de ARN individuales. Tercero, y esto se está volviendo cada vez más relevante, qué tipo de modificaciones tienen lugar en un ARN después de que se realiza en la célula.

El ARN es quizás la molécula más fascinante de la célula, debido al alto grado de plasticidad en su regulación y al gran número de procesos celulares en los que puede influir. Obviamente soy parcial, ya que escribí una tesis de maestría y doctorado sobre ARN.

Gracias por A2A.

El ADN es el almacén de nuestro material genético que incluye todos los genes que codifican las proteínas. Implica las secuencias reguladoras, las regiones de eucromatina y heterocromatina. Durante la transcripción, el ADN se transcribe en ARNm (ARN mensajero) por la ARN polimerasa II. Este ARNm incluye los exones e intrones. Los intrones se empalman aún más mediante el mecanismo de empalme y, por lo tanto, se forma una plantilla de ARN exónico completa que luego se traduce para formar diferentes proteínas mediante procesos alternativos de empalme y combinación de exones.

Por lo tanto, la plantilla de ARN es el factor decisivo para todas las proteínas que se sintetizarán.

Los estudios relacionados con la expresión génica se realizan mediante extracción de ARN y su cuantificación. Este ARN se transcribe inversamente para formar ADNc (ADN complementario) que luego se amplifica tomando un gen de mantenimiento como referencia y, por lo tanto, el nivel de expresión se estudia de manera comparativa.

Es por eso que la extracción de ARN y su estudio es muy importante.

Espero que ayude 🙂

La extracción de ARN se realiza con la ayuda del tampón de tiocianato. Las siguientes son las ventajas de la extracción de ADN:

1.RNA está en muchas formas y m-RNA se utiliza en el almacenamiento de información genética en las bibliotecas de genes …

2.Durante el proceso de secuenciación de proteínas, es fácil obtener la secuencia de proteínas del ARN que del ADN, que también implica el proceso de transcripción.

3.RNA se puede almacenar fácilmente en forma de una sola cadena, mientras que el ADN es bicatenario

La extracción de ARN es realmente importante cuando tienes que estudiar la expresión de proteínas o la expresión de un gen. Es más importante cuando realiza una amplificación por PCR en tiempo real, ya que necesita ARN para obtener ADNc.