¿Cómo encuentro el% de metionina (y leucina) en todas y cada una de las proteínas?

Para encontrar la secuencia de una proteína específica, querrá usar NCBI para buscar en la base de datos de proteínas (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/prot…). Vale la pena señalar que las proteínas relacionadas en diferentes organismos han conservado pero aún varían las secuencias de aminoácidos. Su recuento de aminoácidos para IGF-1 en humanos será diferente que en otros organismos. Una vez que haya encontrado la proteína y el organismo que le interesan (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/prot…), la secuencia de proteínas se proporcionará en formato de letra única (es decir, m para metionina, l para leucina, etc.).

Esta es solo la funcionalidad más básica de NCBI. También puede buscar homología completa en la base de datos de ADN o proteínas para una secuencia de entrada dada (BLAST), alinear múltiples secuencias de ADN y proteínas, construir árboles filogenéticos para mostrar relaciones evolutivas y realizar muchas otras técnicas útiles en bioinformática.

La secuencia de proteínas del sitio web Uniprot (UniProt) y luego usa el servidor ProtParam (herramienta ExPASy – ProtParam) para conocer el porcentaje de composición de aminoácidos. Por ejemplo, verifiqué la información de DRD2, tiene 443 aminoácidos. Hay 15 residuos de metionina (3,4%) y 44 residuos de leucina (9,9%)