La transcripción en procariotas tiene tres etapas: iniciación, alargamiento y terminación, siendo la iniciación típicamente el paso limitante de la velocidad.
La iniciación es un proceso de varios pasos que comprende los siguientes pasos:
- asociación de la enzima central de la ARN polimerasa (RNAP) con el factor de especificidad del promotor σ para formar la holoenzima RNAP;
- unión de holoenzima a la secuencia de reconocimiento del promotor (PRS) aguas arriba del sitio de inicio de la transcripción (TSS) para formar un complejo promotor cerrado (RPc);
- isomerización de la RPc en un complejo promotor abierto (RPo);
- un paso de iniciación abortiva (AI), con RNAP ciclando a través de múltiples ensayos de polimerización con la liberación de “transcripciones abortivas” cortas y reposicionándose en el RPo;
- RNAP promotor escape (autorización del promotor), con el σ70 en transición estructural y perdiendo su control sobre el PRS, seguido de la transcripción entrando en la etapa de alargamiento.
La publicación de altos niveles de transcripciones abortivas en el paso 4 demuestra la existencia de barreras para el proceso de escape y la inestabilidad de los complejos de transcripción iniciales.
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Fuente: Iniciación abortiva – Wikipedia
RNAP no se mueve aguas abajo a lo largo de la cadena de ADN durante la iniciación abortiva. Se las arregla para producir estas transcripciones cortas a través de la compresión de ADN, por lo que se desenrolla y tira de ADN aguas abajo en el sitio activo de la polimerasa sin moverse.
El escape del promotor requiere que se interrumpan las interacciones favorables involucradas en la formación y estabilización del complejo abierto binario RPo, así como las interacciones σ-core de los pasos (1) a (3). La energía para superar la estabilidad de RPo y para impulsar el escape del promotor se deriva de la compresión del ADN, que proporciona aproximadamente 1.0 kcal / mol de energía libre por paso de translocación.
Los factores que determinan qué complejos promotores abiertos continúan para formar productivamente transcripciones completas y cuáles aún no se conocen.
Otras lecturas
Iniciación abortiva – Wikipedia
Transcripción (biología) – Escape del promotor – Wikipedia
Mecanismo de iniciación de la transcripción y escape del promotor por la ARN polimerasa de E. coli (2017)
Inicio de la transcripción de seguimiento y pausa intermedio de la ARN polimerasa de Escherichia coli (2016)
Promotor de autorización y escape en procariotas (2002)