¿Por qué los mamíferos clonados tienen defectos de salud?

En 2001, Rudi Jaenisch demostró que hay cambios epigenéticos en ratones clonados (y en las células madre de las que derivan):

Inestabilidad epigenética en células ES y ratones clonados.
Humpherys D, Eggan K, Akutsu H, Hochedlinger K, Rideout WM 3rd, Biniszkiewicz D, Yanagimachi R, Jaenisch R.
Ciencias. 6 de julio de 2001; 293 (5527): 95-7.

Resumen
La clonación por transferencia nuclear (NT) es un proceso ineficiente en el que la mayoría de los clones mueren antes del nacimiento y los sobrevivientes a menudo muestran anormalidades en el crecimiento. En un esfuerzo por correlacionar la expresión génica con la supervivencia y el sobrecrecimiento fetal, hemos examinado la expresión génica impresa en ambos ratones clonados por transferencia nuclear y en las poblaciones de donantes de células madre embrionarias (ES) de las que derivaron. Se encontró que el estado epigenético del genoma de la célula ES es extremadamente inestable. De manera similar, se observó variación en la expresión del gen impreso en la mayoría de los ratones clonados, incluso en aquellos derivados de células ES del mismo subclón. Muchos de los animales sobrevivieron hasta la edad adulta a pesar de la desregulación genética generalizada, lo que indica que el desarrollo de los mamíferos puede ser bastante tolerante a las aberraciones epigenéticas del genoma. Estos datos implican que incluso los animales clonados aparentemente normales pueden tener anormalidades sutiles en la expresión génica.

En este momento, la mayoría de los científicos ya sospechaban que este era el caso, de todos modos.

Una explicación: telómeros acortados.

Los telómeros son secuencias repetitivas de ADN que se encuentran al final de los cromosomas. Estas secuencias son importantes porque el proceso de replicación del ADN hace que una de las dos cadenas de ADN solo se replique parcialmente. Si no hubiera telómeros, durante la duplicación cromosómica (que precede a la división celular), los cromosomas se acortarían cada vez más, ya que una de las cadenas solo se copiaría parcialmente.

La telomerasa es una enzima que extiende y repara los telómeros, protegiendo así el final de los cromosomas y manteniendo la integridad del material genético de la célula. La telomerasa solo está activa en ciertos puntos durante el desarrollo. En los mamíferos clonados a partir de núcleos tomados de células completamente diferenciadas, la telomerasa puede no estar activa, por lo tanto, en el proceso de duplicación cromosómica, los extremos cromosómicos se dañan y no pueden repararse. Con el tiempo, esto conduce a defectos genéticos que conducen a problemas de salud. Se descubrió que Dolly, el primer mamífero clonado, acortó los telómeros.