No estoy exactamente seguro de a qué te refieres. Así que para ser claros:
- Cuando dices secuencias de genes, ¿te refieres a dos genes enteros? ¿O estás hablando de dos exones en un gen dado?
- ¿De qué organismo estamos hablando?
- ¿Qué nivel de cambio de expresión es lo suficientemente pequeño como para definirlo como “sin efecto”? 0.0000000000000% de aumento en uno? 1% de aumento en uno? ¿Un cambio detectable (por qué método?)?
- “Afecto en su expresión”. Supongo que te refieres a la expresión de proteínas, ¿verdad? ¿O la expresión de ARNm, como si, por ejemplo, usara qPCR para evaluar esto?
- Cuando dice conectar, ¿quiere decir que el último codón de uno si es seguido inmediatamente por el primer codón del siguiente? ¿O están bien los enlazadores?
- Si hay dos genes completos, ¿qué genes y qué gobierna su expresión tal como es? ¿Qué promotor se usa para cada uno, en qué célula se expresan (qué tipo de regulación génica ocurre a qué horas en la célula dada), cuál es el estado epigenético de cada uno, etc. Con énfasis en ” etc. “; Hay muchos más factores que debe definir para cualquier posibilidad de responder de manera significativa.
Entonces, dada la vaga pregunta, puedo darte algunas pistas, que podrías considerar. Algunas cosas que valen la pena considerar, dependiendo de las circunstancias exactas.
Haré algunas suposiciones y responderé a partir de eso. Simplemente deje un comentario con ( mucha ) más información, si desea una mejor respuesta. Pero desafortunadamente, la respuesta corta es que será difícil.
- ¿Cuáles son los obstáculos para secuenciar genomas de plantas en comparación con genomas de animales?
- ¿Qué otras estructuras químicas podrían realizar las funciones del ADN?
- ¿Existe la posibilidad de que el ADN 'basura' pueda ser comentarios de la naturaleza en nuestra programación de la misma manera que los programadores agregan comentarios en su código para ayudar a otros que desean editar?
- ¿Para qué proteína codifica el gen BolA2?
- ¿Cuál es la estructura del operón lac?
Suposiciones
- Dos genes, no exones “solo” (si son exones, puede reemplazar el gen con el ADNc)
- Humanos (tenemos una tendencia a pensar que los humanos son más interesantes que otros organismos). Es posible que desee mirar en el Operon. Y en contraste con lo que los libros de texto nos dijeron cuando tenía bioquímica básica, ¡no se limita a los procariotas!
- Seré vago aquí también, y solo diré “cambios menores”.
- Asumiré la expresión de proteínas. Que es una combinación de transcripción y traducción, así como elementos reguladores intermedios (por ejemplo, miRNA que podrá unirse y regular diferencialmente, si comienza a cambiar la secuencia de ARNm como estamos hablando).
- Asumiré de nuevo que te refieres a simplemente ensamblado en un operón. No creo que pueda obtener la traducción del segundo gen si su “AUG” se encuentra inmediatamente adyacente al codón de terminación del gen 1.
- Por lo general, los genes “reales” tienen varios codones de terminación que se siguen entre sí, ya que a veces hay errores. Ciertas condiciones, así como medicamentos como los aminoglucósidos pueden inducir una mayor cantidad de lectura del codón de terminación). Entonces, con solo uno, seguido de su gen 2, una pequeña porción de su proteína sería una proteína de fusión.
- Entonces, aquí hay un punto importante. Si desea “combinar” dos genes, estarán bajo un solo promotor. Entonces tendrán el mismo nivel de expresión. La única forma de hacerlo sin cambiar el nivel de expresión de ninguno de los dos es encontrar dos genes que tengan exactamente el mismo nivel de expresión antes de comenzar. Y esto es prácticamente imposible. Al menos en todas las condiciones. Porque los niveles de expresión cambiarán. Cambio en el tiempo, cambio en respuesta a millones de diferentes tipos de estímulos, etc. Además, el promotor no es el único punto de regulación. Deberá seleccionar con mucho cuidado los genes que desea fusionar. Prácticamente, esto es imposible. Pero dada una tolerancia lo suficientemente amplia para su margen de error, seguro, podemos intentarlo.
En resumen, no puedes. Pero si acepta grandes errores en sus niveles de expresión, puede acercarse un poco. Haga un operón bajo un promotor que tenga un nivel de actividad similar al de los dos promotores nativos de sus genes de interés (GOI). Asegúrese de encontrar genes con la menor cantidad posible de otra regulación, y que tengan los mismos niveles de expresión antes de fusionarlos, en el sistema que le interesa. Asegúrese de tener suficiente espacio entre ellos en su operón. Y asegúrese de que tengan un tamaño similar y una complejidad traslacional.
Como dije, si tiene información adicional sobre lo que desea, deje un comentario y es posible que podamos acercarnos a lo que tenía en mente.
