¿Cómo se usa la teoría de nudos para comprender la estructura del ADN?

Incluso en una clase de bioquímica de nivel de entrada, surgen conceptos básicos de la teoría de nudos porque el ADN anudado puede almacenarse de manera más compacta que el ADN anudado. Sin embargo, las proteínas que necesitan acceder al ADN no pueden hacerlo muy fácilmente en forma anudada. Debido a que existen diferencias de energía en el ADN anudado y anudado, surgen conceptos básicos como el número de bobinado para cuantificar esto.

Hay mucho interés en las proteínas que anudan y desatan:
Topoisomerasa

Tengo entendido que lo sorprendente de estas proteínas es que pueden descubrir de manera tan eficiente cómo desanudar las cosas. Como cualquiera que haya estudiado la teoría de nudos sabe, si me das un nudo orientado arbitrariamente, determinar si es el nudo (y, si no, dónde cortarlo para que sea el nudo) es un problema muy difícil. Estas proteínas parecen ser capaces de resolver este problema notablemente rápido.

La topoisomerasa y las estructuras compactas (debido a la modificación epigenética de la cromatina) son los ejemplos más comunes. Sin embargo, no hay mucha teoría de nudos desde una perspectiva matemática involucrada.