El daño que un ácido o un álcali puede causar al ADN depende de la concentración en la que está exponiendo el ácido nucleico al químico respectivo y también otro factor importante a considerar aquí es qué tipo de ADN se considera, es decir, ADN genómico o plásmido ADN, si es genómico, ya sea procariota, viral o eucariota, etc.
· Considerando el efecto del álcali en el ADN genómico:
1. Si el ADN está expuesto a una baja concentración de álcali:
La baja concentración de álcali no será demasiado perjudicial para el ácido nucleico, aunque obviamente se incurre en algún daño, como por ejemplo la desnaturalización de algunas proteínas de unión o la ruptura de algunos enlaces de hidrógeno del emparejamiento de bases, etc.
2. Si el ADN está expuesto a una concentración moderada de álcali:
El concentrado moderado de álcali provoca la desprotonación y el enlace de hidrógeno entre los pares de bases se interrumpe y el ADN se desnaturaliza.
3. Si el ADN está expuesto a una alta concentración de álcali:
La alta concentración de base inducirá una hidrólisis de los enlaces fosfodiéster del ADN y el ADN se dividirá en fragmentos más pequeños.
El tratamiento alcalino a menudo se usa para aislar el ADN plasmídico o cualquier otro material cromosómico adicional a fin de garantizar la degradación del ADN genómico para evitar su contaminación en el producto deseado.
Puede consultar: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/… una descripción detallada y más precisa.
· Considerando el efecto del ácido sobre el ADN genómico:
1. Si el ADN está expuesto a condiciones de pH bajo:
A pH bajo, es decir, condiciones ácidas, el ADN se ve privado de las purinas. Esto provoca la fusión del ADN. Además, dado que el contenido de A + G se pierde, se pierde el 50% de la secuencia del ADN.
2.Si el ADN está expuesto a condiciones de pH extremadamente bajo (pH <3)
A un pH extremadamente bajo, es decir, en condiciones de alta acidez, se rompe el enlace fosfodiéster del ADN, que escinde el ADN en nucleósidos y nucleótidos.
El efecto del ácido sobre el ADN es la razón por la cual el pH en el estómago es bajo. Dado que el pH se acerca a 2.0, la mayor parte de la carga bacteriana se reduce antes de la digestión y la comida descontaminada se transmite aún más.
¿Cómo los ácidos y las bases dañan el ADN?
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En términos simples: los ácidos y las bases destruyen los enlaces covalentes que mantienen unidos los pares de bases en una cadena de ADN.
En términos químicos: los ácidos y las bases catalizan la hidrólisis de los enlaces fosfodiéster en el esqueleto de fosfato desoxirribosa.
La hidrólisis es lenta (prácticamente inexistente) a pH neutro. El aumento del pH produce hidróxido, que es un nucleófilo mucho mejor que el agua y da como resultado un ataque nucleófilo del átomo de fósforo, que finalmente conduce a la hidrólisis del enlace fosfodiéster.
editar: en realidad no estoy seguro de cuál es la reacción catalizada por el ácido. Actualizaré mi respuesta después de revisar algunos documentos / libros.
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