Cuando dos moléculas tienen los mismos átomos presentes, pero diferentes estructuras, se conocen como isómeros. Sin embargo, lo que sugiere son moléculas con la misma estructura pero con componentes diferentes. Sugeriría que describirlos con la misma estructura sería una descripción bastante flexible. Una molécula C2H4 y una molécula C2H2Cl2 no tendrán la misma estructura. La electrostática no lo permite. Los enlaces serán de diferentes longitudes, los ángulos entre los enlaces también serán diferentes. Intercambiar los átomos en una estructura es una buena forma de adivinar qué moléculas son posibles, pero en realidad no se pueden describir como iso-nada, ya que ni la composición ni la forma permanecen iguales cuando comienzas a intercambiar átomos.
Tome CO2 y H2O como ejemplo. Se podría decir que tienen la misma estructura, un átomo en el medio, dos a cada lado, pero la electrostática hace que las moléculas de agua se doblen, mientras que las moléculas de dióxido de carbono no.
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