Con algunas excepciones, los genomas generalmente no están adaptados para el tamaño. Los genomas pequeños tienen una ventaja insignificante en la aptitud física directa, por lo que la deriva aleatoria generalmente supera los efectos de la selección natural. Pero a lo que se refiere es más complicado: la idea de que el genoma debería adaptarse para ser “más fácil de codificar”. Este es un argumento fundamentalmente diferente de decir que el genoma debería ser pequeño porque la replicación cuesta energía: dice que los organismos deberían adaptar el código en sí, no su representación física ni sus salidas.
Si bien no se conoce el efecto que tiene el tamaño del genoma en esto, la evolución para la evolución es una propiedad conocida (y fascinante) de los sistemas en evolución: los genomas que están estructurados de tal manera que faciliten una evolución más rápida o mejor, tendrán una descendencia de mayor aptitud en promedio, y por lo tanto, esta propiedad se seleccionará naturalmente en las condiciones adecuadas.
Para dar un ejemplo concreto, este artículo presenta un sistema evolutivo artificial, donde los individuos se parecen abstractamente a redes reguladoras de genes. Las redes implican un sistema de ecuaciones, y las que dan resultados más correctos se les asigna una mayor aptitud, es decir, una mayor probabilidad de sobrevivir y convertirse en una plantilla para un nuevo individuo (con mutaciones). Redes que evolucionaron en un entorno donde las salidas requeridas cambiaban continuamente, adaptadas de tal manera que un pequeño interruptor en la entrada podría dar una salida totalmente diferente, permitiendo así una rápida evolución cuando los requisitos óptimos cambiaran. Por el contrario, las redes evolucionaron en un entorno estático que solo se adaptó a ese entorno, y no pudieron adaptarse tan rápido cuando se les presentó una condición física diferente. En otras palabras, las redes de genes se adaptaron a la capacidad de evolucionar.
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Se pueden hacer observaciones similares en biología real. Los genes que están más a menudo bajo presión selectiva para evolucionar en diferentes entornos, están sobrerrepresentados en regiones del genoma que son más propensas a errores. Esto se debe a que las personas donde los genes se colocan en regiones propensas a errores tienen más probabilidades de producir descendencia de alta aptitud en condiciones estresantes, por lo que estos genomas se seleccionarán naturalmente cuando tales condiciones surjan con la suficiente frecuencia. Esto es consistente con otros hallazgos, que las bacterias son capaces de modificar su propia tasa de mutación en condiciones estresantes para facilitar una evolución más rápida; la diferencia es que aquí, adaptan la tasa de mutación al gen, en lugar del medio ambiente.
