Al transcribir ADN a ARNm, ¿primero tiene que encontrar la cadena de ADN complementaria?

No, no tiene que encontrar primero la cadena complementaria. Con una excepción, pero lo describiré al final.

Hay dos reglas para responder a su pregunta:

  1. Es convencional enumerar secuencias en orientación de 5 ‘a 3’
  2. El ARN siempre se transcribe en orientación de 5 ‘a 3’

Imagine la siguiente situación:

Secuencia de ADN ATGAGCTGAAGCTGA

Al aplicar la regla (1), la región de ADN complementaria (antes de la transcripción) se ve así:

5 ′ ATGAGCTGAAGCTGA 3 ′
3 ′ TACTCGACTTCGACT 5 ′

Ahora, para poder sintetizar el ARN complementario para nuestra secuencia de ADN original, no podemos tomar su secuencia original como plantilla, porque está en orientación de 5 ‘a 3’, y el ARN complementario generado crecería en 3 ‘a 5’ orientación. Recuerda la regla (2).

Por lo tanto, necesitamos tomar la secuencia de ADN complementaria (3 ‘a 5’) para sintetizar ARN complementario de 5 ‘a 3’.

ARN 5 ‘AUGAGCTGAAGACGA 3’
ADN 3 ′ TACTCGACTTCGACT 5 ′

Como puede ver, el ARN resultante es equivalente a la secuencia de ADN original. Técnicamente se sintetizó utilizando la cadena complementaria. Sin embargo, desde una perspectiva práctica para saber cuál será la secuencia de ARN resultante, no necesita conocer la cadena complementaria de su secuencia de ADN original.

Eso puede sonar un poco contradictorio, pero desde una perspectiva práctica significa solo eso: usted sabe que este es el proceso bioquímico, pero la secuencia de ARN resultante (no solo ARNm, es decir) será idéntica en secuencia a la secuencia de ADN en cuestión , con la excepción de que T se convierte en U. Entonces, digamos que tiene un gen específico codificante o no codificador detectado por algún método, la secuencia resultante de ARN (ARNm, snoRNA, miRNA, …) será idéntica (aún T a U), no complementario a esto.

La excepción antes mencionada es esta, si hay una mutación en la secuencia de ADN complementaria original. Eso debe corregirse mediante mecanismos de reparación, pero, sin embargo, puede existir bajo ciertas circunstancias. es decir, en la región complementaria original:

5 ′ ATGAGCTGAAGCTGA 3 ′
3 ′ TACTCGACTT A GACT 5 ′

En ese caso, esta mutación (C-> A) se copiaría en la secuencia de ARN resultante durante la transcripción. Sin embargo, este no es un problema práctico cuando se trabaja con secuencias genómicas, pero puede suceder (y ciertamente ocurre) en los procesos de transcripción continua de la célula.

También hay este libro en línea en el repositorio de NCBI, que parece ser muy útil: Introducción al análisis genético. 7ma edición.

Por cierto, la situación, naturalmente, también puede revertirse. Al leer la cadena de ADN complementaria de orientación 5 ‘a 3’ … Por lo tanto, la información alternativa puede codificarse en la misma región, aunque esto es menos típico. Bioquímicamente no hace diferencia.

La respuesta es algo ortogonal a cómo se formula la pregunta:

Lo que hace que un ARNm ARNm dependa de algunas características del ADN, que incluyen cosas como un motivo de unión al ribosoma, una secuencia de Kozak (para eucariotas) o Shine-Delgado (para bacterias) y un codón de inicio. Una cadena de ADN se verá exactamente como el ARNm producido, y esto se conoce como la cadena sensorial. La otra cadena es la que realmente se transcribe para generar ARNm, pero la secuencia es complementaria a la secuencia de ARN, llamada cadena antisentido.

Sin embargo, en última instancia, casi todo el ADN se transcribe en ARN, pero solo la fracción que cumple los requisitos antes mencionados es reconocida por la maquinaria de traducción.

Depende del código de cadena de plantilla (una de las dos cadenas que se convertirán en ARNm).

Si su código de ADN de plantilla es GTG, el código de ARNm es CAC

RECUERDE: el ARNm es complementario a la cadena de ADN de plantilla, pero está compuesto de nucleótidos de ribosa (rNTP) y contiene uracilo en lugar de timidina