El grupo usa un sistema de 19 bits para codificar la dirección y, de hecho, utiliza un sistema de base 2 donde A y C se consideraron 0 y G y T se consideraron 1.
Codificación
El archivo codificado de The Tale of Two Cities y otros materiales, incluidas las fotos, se convirtieron en un archivo html que se tradujo al lenguaje binario utilizando un script perl. El uso de un sistema de base 2 permite el diseño de 54.898 oligos superpuestos para contar la historia de 5,27 megabits
Síntesis
La biblioteca de ADN se sintetizó utilizando la plataforma de microarrays Agilent Oligo Library Synthesis. A partir de esta biblioteca, los oligos se ensamblaron mediante 10 rondas de PCR de ensamblaje seguidas de 9 rondas de amplificación por PCR.
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Secuencia
La plantilla de ADN final se puede usar para la secuenciación de Illumina Solexa. El HiSeq 2000 les permitió obtener una cobertura de 100 veces del “libro” de ADN y con la secuencia de pares, pudieron obtener lecturas de 100 pb con bajos errores. Para ensamblar contigs, usaron SeqPrep y para alinear aún más esos contigs, se usaron Bowtie y SamTools.
Descodificación
Para obtener una lectura de consenso, utilizaron un script de Python para volver a ensamblar las lecturas de alta calidad de 115 pb. Usando la dirección de 19 bits, pueden comenzar a leer la historia y traducir el As, Cs, Gs y Ts nuevamente en 1s y 0s