Probablemente no tendremos la capacidad de plegar proteínas humanas de novo durante otros 30-40 años. Claro que podemos hacer algunas proteínas grandes, pero esas son principalmente proteínas solubles, no de membrana, no modificadas, mientras que una porción saludable de proteínas humanas no es ninguna de ellas.
El Human Protein Atlas monitorea alrededor de 15,000 genes codificadores de proteínas. El Proyecto Genoma Humano estima que hay alrededor de 20,000. También hay todas las diversas isoformas de empalme, pero supongamos que lo que estamos preguntando es cuándo llegaremos a resolver 20,000.
Si visitas PDB y seleccionas “Homo sapien” y “protein”, ¡obtenemos 20430 proteínas! ¡Entonces nuestro trabajo está hecho! Sin embargo, es probable que esto incluya varios miles de anticuerpos. Si aumentamos nuestro umbral para excluir proteínas con un 30% o más de similitud, ese número se reduce a 3.753 estructuras. Incluso entonces, simplemente en la primera página veo varias repeticiones y estructuras de RMN de proteínas truncadas.
- ¿Qué pasaría si el ADN tuviera incluso menos grupos -OH?
- ¿Cuáles son los diferentes tipos de recombinación?
- ¿Por qué hay tantos tipos diferentes de ARN de transferencia?
- ¿Por qué los aptámeros no se usan más en la detección de proteínas frente a los anticuerpos?
- Si el ARN fuera el material genético universal, ¿qué efecto habría tenido en los experimentos de Griffith, Avery y Hershey-Chase?
RCSB PDB – Resultados de la consulta
Para darle una idea de qué tan atrasados estamos en nuestros esfuerzos, puede verificar el estado de Protein Structure Factory, una instalación dedicada para resolver estructuras humanas que finalizó en 2007, no progresaron mucho.
Estado de PSF
Lo mismo ocurre con el Centro de Genómica Estructural Eucariota y el Consorcio de Genómica Estructural (Logros clave)
Ahora para los datos reales:
Según TargetTrack, hay
- 24541 objetivos humanos
- 13903 ADNc clonados
- 10224 proteínas expresadas
- 4329 proteínas purificadas
- 1719 proteínas con difracción o datos de RMN
- 1505 estructuras resueltas
- 1458 estructuras en el pdb
Actualmente estamos a solo el 6% del camino al 99.99%.