¿Por qué la ADN polimerasa solo reconoce dNTP y por qué la ARN polimerasa solo reconoce rNTP?

Para darle los detalles de DNA Pol excluyendo ribonucleótidos, eche un vistazo a esta imagen:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc…

La parte B es la clave: si mira hacia dónde apunta la flecha, le muestra dónde descendería el oxígeno rojo SI tuviera un riboncleótido allí. No se puede ver toda la esfera roja de oxígeno porque está ocupando exactamente el mismo espacio que los carbonos de color verde de uno de los aminoácidos (tirosina # 12) de una estructura de ADN polimerasa. Los átomos no pueden hacer esto; cada uno requiere su propio espacio y no pueden superponerse.

La Figura A muestra cómo un desoxirribonucleótido no tiene este problema; la figura C muestra que si la tirosina fuera una alanina, predecimos que un ADN Pol podría permitir que los ribonucleótidos encajen. El siguiente documento presenta evidencia de que esto realmente sucede.

Aquí está el papel; es bastante detallado, pero si realmente quiere “ver” la exclusión, está aquí, así como varias otras mutaciones y una discusión de por qué podrían permitir el reconocimiento ampliado.

http://www.gatebiotech.com

La relación intracelular de rNTP / dNTP es muy alta.

ADN polimerasa : discrimina activamente contra rNTP a través de una ” puerta ESTERICA ” formada por las cadenas laterales Glu y Phe, que excluye el grupo 2′-OH de rNTP.

Pero debido a la alta concentración de rNTP, Pol δ y ε aún los incorporan al ADN. La tasa de incorporación de rNTP es de 1 en 1000 dNTP. Pero se reconocen por falta de coincidencia y se eliminan continuamente por las respectivas polimerasas a través de la actividad intrínseca de 3′-exonucleasa (corrección de pruebas).

ARN polimerasa : mientras que el ADN pol selecciona negativamente los rNTP y los elimina, el ARN pol selecciona positivamente los rNTP. Reconoce la ribosa a través de la formación de ” BONO DE HIDRÓGENO” entre el grupo -OH de Tyr 639 de RNA Pol y el grupo 2′-OH de rNTP.

Siempre estoy tentado de responder preguntas de ciencia “POR QUÉ” con

“Porque Dios así lo dijo”.

Creo que te refieres a CÓMO.

Las enzimas han evolucionado para tener una selectividad exquisita porque los errores del sustrato (a veces) interferirían fatalmente con sus diversos roles, métodos de regulación y el flujo de información. El “cómo” exacto implica el OH adicional en la porción ribosa, cuyos detalles se encuentran en la literatura.

Creo que debido a que los dntps tienen azúcares de desoxy ribosa y los rntps tienen azúcares de ribosa simples, esta diferencia ayuda a esas polimerasas a reconocer los nucleótidos respectivos e incluso su composición de base de nitrógeno varía, es decir. El ARN tendrá bases de uridina en lugar de timidina a partir del ADN