Hay varias capas en la pregunta, pero se reduce a: el miRNA y el mRNA están regulados de manera diferente, y pueden no mostrar madurez 1: 1. Del mismo modo, incluso si lo hacen, la actividad de RISC va a depender mucho de los otros miRNA en la célula y del número de posibles transcripciones que el miRNA que mencionó puede tener como objetivo. Cuantos más objetivos posibles tenga un miRNA, menor será su impacto en cualquier objetivo individual.
En cuanto a la regulación, el intrón que contiene el miRNA primero necesita empalmarse, luego Drosha corta el pre-miR. En ese punto, el bucle del tallo necesita ser traficado fuera del núcleo, que en ocasiones está mediado por interacciones directas con proteínas SMAD. Esta interacción depende de la secuencia: es posible que otras proteínas jueguen un papel similar y simplemente no las hemos identificado todavía. Una vez fuera del núcleo, el miRNA necesita ser escindido por Dicer e incorporado en RISC. En cada etapa de esa vía, el miRNA puede regularse, posiblemente haciendo que nunca madure, mientras que la transcripción del host puede traducirse sin impedimentos. Sin embargo, los miRNA tienen una vida media bastante larga, por lo que es posible que se acumule suficiente cantidad de miRNA con el tiempo para interrumpir la traducción del gen huésped, lo que lleva a un patrón de expresión (a nivel de proteína) que aumentaría y luego se caería constantemente .
Finalmente, vale la pena señalar que los miRNA raramente silencian un gen por completo. Por lo general, reducen la actividad de un gen en un 20–80%, dejando un puñado de transcripciones que escapan a la represión y se traducen con éxito. Por lo tanto, el miRNA podría terminar teniendo una represión estática del 50% de la transcripción del huésped, y podría ser importante desde un punto de vista evolutivo, tal vez el gen del huésped históricamente ha sido alto en el linaje, y el miRNA recientemente ha mutado para apuntar a la transcripción del huésped como parte de un evento de especiación. ¡Hay muchas posibilidades!
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