La lisis alcalina se usa en los laboratorios de biología molecular para aislar el ADN plasmídico de las bacterias (99,9% de las veces, esto es E. coli ). Las soluciones utilizadas en la lisis alcalina son las siguientes:
1. Solución de EDTA, que actúa como inhibidor de la DNasa al quelar los iones metálicos que actúan como cofactores de estas enzimas.
2. Solución de NaOH y SDS, que realiza la lisis real al alterar las membranas celulares y desnaturalizar el ADN. Esto ocurre porque el SDS (docecil sulfato de sodio), un desnaturalizante, solubiliza la membrana, permitiendo que el NaOH (el álcali) desnaturalice el ADN.
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3. Una solución de ácido débil, generalmente un poco de sal de acetato, que renaturaliza el ADN plasmídico neutralizando el álcali. Esto le permite aislarse mediante centrifugación.
En términos de aplicaciones, la lisis alcalina es una de las técnicas más integrales para la biología molecular. La forma más fácil y efectiva de clonar grandes cantidades de ADN del tamaño de un plásmido es en E. coli , y realizar lisis como esta es la única forma de aislar nuevamente el ADN del plásmido.
La mayor parte de esta respuesta se puede encontrar en Molecular Biology of the Cell por Alberts.
