¡Si seguro! Esto suena divertido.
Para explicar lo que significa esta cosa 3′-5 ‘, tengo que describir la estructura del ADN.
El ADN / ARN tiene una columna vertebral hecha de desoxirribosa (para ADN) y ribosa (para ARN). De hecho, la D en el ADN significa Deoxyribo. La columna vertebral hecha de estos azúcares no será simétrica.
Probablemente notará que los carbonos en esta imagen están numerados. Esta es la forma típica de numerar los carbonos de cualquier compuesto orgánico para que los químicos puedan referirse fácilmente a un carbono cuando lo deseen. Para hacer una columna vertebral, tienen que conectarse una tras otra para hacer una cadena o polímero.
Aquí hay una molécula de ADN sin enrollar. Notarás dónde están las desoxirribosas. Si observa detenidamente, notará que una desoxirribosa se une a otra conectando su carbono 5 ‘al carbono 3’ del otro utilizando un grupo fosfato (ese es el grupo PO4). Las cadenas tienen que terminar eventualmente (asumiendo su ADN lineal en lugar de ADN circular). Por lo tanto, una parte terminará con un carbono libre libre de 5 ‘y el otro extremo tendrá un carbono libre libre de 3’. Este hecho se usa para hablar sobre el ADN y en qué dirección se moverán las cosas a lo largo de la molécula de ADN.
Aquí los extremos están etiquetados y cada punto rojo denota un carbono 5 ‘mientras que cada punto verde etiqueta un carbono 3’.
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Todo este tiempo, he estado hablando de cadenas individuales de ADN. Por supuesto, el ADN a menudo es bicatenario. La cadena complementaria va en la dirección opuesta.
Esto se vuelve bastante importante cuando aprende sobre todas las diversas proteínas que interactúan con el ADN para la replicación, reparación, traducción y otras cosas.
Por ejemplo, cuando una célula se está preparando para dividirse, replica su ADN usando una proteína llamada ADN polimerasa. La ADN polimerasa funciona en el ADN monocatenario, pasando del extremo 3 ‘al 5’ formando una cadena complementaria.
Notarás que debido a que tiene que moverse 3 ‘a 5’, sucede algo interesante. En una cadena, la polimerasa puede seguir yendo en la misma dirección en que la helicasa de ADN desenrolla el ADN. Pero en la otra cadena, la ADN polimerasa tiene que viajar en la dirección opuesta. Este hilo se llama el hilo rezagado. Podría esperar a que la helicasa desenrolle todo el ADN y luego comenzar a replicar esa cadena de una vez, pero eso tomaría una eternidad. En cambio, replica pequeños fragmentos a la vez, esperando un poco a que la helicasa de ADN desenrolle más ADN, y luego comienza otro fragmento. Estos fragmentos tienen que unirse luego por una ligasa, pero aún así es mucho más rápido hacerlo de esta manera que esperar a que el extremo 3 ‘de esa cadena de ADN se libere.