Los codones de parada son esenciales para la terminación del proceso de traducción. No codifican ningún aminoácido, sino que son el punto de acceso para que se unan los factores de liberación. Si no hay un codón de parada en el ARNm, existe la posibilidad de que el ribosoma sintetice ARNm hasta que no se encuentre el extremo 3 ‘del ARNm. En el extremo 3 ‘, no hay codón y, por lo tanto, el ribosoma no puede avanzar más. La consecuencia de esta situación es que el ribosoma quedará atrapado con ARNm para siempre, ya que no hay codón para el ARNt o factores de liberación en el ARNm para terminar la traducción y comenzar un nuevo ciclo de ribosomas.
Sin embargo, los procariotas tienen un mecanismo para prevenir tal situación. Tales ribosomas estancados son rescatados por la acción de una molécula de ARN quimérico que es una combinación de ARNt y ARNm llamada ARNm. El ejemplo más común del tmRNA es SsrA, que es 475 nucleótidos. Incluye una región en su extremo 3 ‘que es similar al tRNA para Ala. Esta similitud permitiría que el tmRNA SsrA agregue alanina a su extremo 3’. Una vez que el aminoácido se carga en el tmRNA, el tmRNA se unirá al EF-Tu-GTP y luego al sitio A. Esto conduciría a la translocación del enlace peptídico a la alanina, y el ARNm se liberará del ribosoma en un estado roto. El ARNm también tiene un componente de ARNm que entraría en el canal ribosómico. Este ARNm comenzará a codificar péptidos cortos de diez aminoácidos que se agregarían o ‘etiquetarían’ a la cadena de péptidos en crecimiento del ARNm defectuoso.
La adición de péptido corto a la proteína es esencial. Ciertas proteasas celulares reconocen la secuencia de los diez aminoácidos del péptido corto que se agregó y, por lo tanto, la proteína defectuosa sintetizada a partir del ARNm defectuoso se degrada.
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Referencia y lecturas sugeridas:
- Watson, JD y Watson, JD, 2008. Biología molecular del gen (No. Sirsi) i9780805395921).
- Karzai, AW, Susskind, MM y Sauer, RT, 1999. SmpB, una proteína única de unión a ARN esencial para la actividad marcadora de péptidos de SsrA (tmRNA). The EMBO journal , 18 (13), pp.3793-3799.
- Julio, SM, Heithoff, DM y Mahan, MJ, 2000. ssrA (tmRNA) juega un papel en la patogénesis de Typhimurium en Salmonella enterica serovar. Journal of bacteriology , 182 (6), págs. 1558-1563.
- Gottesman, S., Roche, E., Zhou, Y. y Sauer, RT, 1998. Las proteasas ClpXP y ClpAP degradan proteínas con colas de péptidos carboxi terminales añadidas por el sistema de marcado SsrA. Genes y desarrollo , 12 (9), pp.1338-1347.
