¿Por qué hay tan poca investigación sobre polimorfismos multinucleotídicos?

1. No están claramente definidos. Ni siquiera había oído hablar del término hasta que hiciste esta pregunta. Literalmente hablando, indels y microsatélites son polimorfismos multinucleotídicos. Esos polimorfismos están bien estudiados.
2. Para un genetista, estos son solo SNP consecutivos, o son solo un haplotipo. Los genetistas generalmente solo se preocupan por los parámetros básicos: la mayoría de los análisis los tratan como 0 y 1.
2b. A lo sumo, los genetistas de población quieren saber la tasa de mutación; si esto difiere de los SNP, esto sería de interés. Pero la tasa de mutación puede ser notoriamente difícil de estimar.
3. Lo más importante, no son comunes en comparación con los SNP. Revisé uno de los pocos documentos que discute sobre MNP y son al menos 60 veces menos comunes. Además, los SNP son populares porque se puntúan fácilmente y están bien distribuidos entre los genomas.
4. Muchos MNP son solo SNP consecutivos.

Todo eso deja a las pocas MNP que en realidad son distintas en sus orígenes mutacionales. No veo mucha investigación sobre los mecanismos moleculares o bioquímicos o la mutación en estos días. Pero tal vez eso cambie.