Primero, no todos los átomos son idénticos: un átomo de oxígeno y un átomo de uranio son bastante diferentes.
Segundo, los átomos no son partículas elementales, y no siempre se puede ignorar su estructura interna.
El enredo cuántico no reclama nada. Es el resultado de la naturaleza probabilística de la mecánica cuántica. Se pueden correlacionar dos variables aleatorias: el resultado de una dependerá de la otra.
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Piense en la lotería, diga que tiene una probabilidad [matemática] 0 <p <1 [/ matemática] de ganar (aquí definiré ganar como adivinar todos los números correctamente). Si usted y yo suponemos independientemente que la probabilidad de que ambos ganemos es [matemática] p ^ 2 [/ matemática]. Estas conjeturas no están correlacionadas. Le permite adivinar un conjunto diferente de números que la probabilidad de que ganamos es [matemática] 0 <p ^ 2 [/ matemática] (ya que solo hay una respuesta correcta). Estas conjeturas están negativamente correlacionadas. Supongamos que adivinó dos veces el mismo número (es el número de la suerte) que la probabilidad de que esté correcto es [matemática] p [/ matemática] y estas suposiciones están positivamente correlacionadas.
Los estados cuánticos pueden comportarse así. La correlación tiende a disminuir en el tiempo. No necesitas partículas idénticas para eso. Las partículas idénticas tienen otras consecuencias, como la condensación de Bose-Einstein y la superfluidez.