Se utiliza una transferencia Southern para detectar la presencia de una determinada secuencia de ADN en su muestra (Western Blot = proteínas, Northern = ARN). Del mismo modo, una transferencia de ranura es un método para detectar ADN, ARN o proteínas específicos en su muestra. La diferencia clave es que si bien la electroforesis es un paso preliminar en el caso de Southern Blot (también Westerns y Northerns), las transferencias de ranura no emplean este método.
Aquí hay un gran video de cómo funciona Southern blot (creo que podría explicar más que si escribiera):
Sin embargo, en una transferencia de ranura, no se realiza el primer paso para separar los fragmentos de ADN según el tamaño mediante electroforesis. Por lo tanto, una mancha de ranura no nos dice nada sobre el tamaño del ADN. Así es como se ve una mancha de ranura:
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Debido a los pasos menores, una transferencia de ranura es más rápida que una transferencia del sur y se requiere menos equipo. Sin embargo, no nos dice nada sobre el tamaño y solo nos dice si nuestro ADN / ARN / proteínas está presente o no.
Las transferencias de ranura se utilizan para evaluar la presencia de clamidia, fiebre tifoidea y tuberculosis.