El asa de sarcina-ricina (SRL) es una región en la gran subunidad de ARN ribsomal. Es la región más grande universalmente conservada del ribosoma, lo que subraya su importancia en la función del ribosoma. Como su nombre lo sugiere, esta región es el blanco de las toxinas sarcina y ricina, que son altamente tóxicas para las células. Se sabe que el SRL interactúa con muchos de los factores de traducción de GTPasa como EF-Tu, EF-G, IF-2 y RF-3, pero su función exacta no se comprende completamente.
Un estudio estructural del ribosoma sugiere que el papel del SRL en la traducción es colocar una histidina catalítica en EF-Tu (y presumiblemente otros factores de GTPasa) para la hidrólisis de GTP. [1] Sin embargo, un estudio bioquímico más reciente mostró que el SRL no es esencial para la hidrólisis de GTP. [2] En cambio, su evidencia indica que el SRL está más involucrado en la translocación y la unión de EF-G. En otro artículo, la eliminación de la SRL causó interrupciones importantes en la estructura del ribosoma, lo que sugiere que la SRL se comunica con el núcleo funcional del ribosoma. [3]
- RM Voorhees, TM Schmeing, AC Kelley, V. Ramakrishnan. El mecanismo para la activación de la hidrólisis de GTP en el ribosoma. Science, 330 (2010), págs. 835–838.
- Xinying Shi, Prashant K. Khade, Karissa Y. Sanbonmatsu, Simpson Joseph, Función funcional del bucle Sarcin-Ricin del 23S rRNA en el ciclo de elongación de la síntesis de proteínas, Journal of Molecular Biology, Volumen 419, Temas 3–4, 8 Junio de 2012, páginas 125-138, ISSN 0022-2836, http://dx.doi.org/10.1016/j.jmb.2012.03.016.
- Lancaster L1, Lambert NJ, Maklan EJ, Horan LH, Noller HF. El asa de sarcina-ricina del 23S rRNA es esencial para el ensamblaje del núcleo funcional de la subunidad ribosómica 50S. ARN Oct de 2008; 14 (10): 1999-2012. doi: 10.1261 / rna.1202108. Epub 2008 28 de agosto.
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