¿Cuál es el papel del bucle Sarcin / Ricin?

El asa de sarcina-ricina (SRL) es una región en la gran subunidad de ARN ribsomal. Es la región más grande universalmente conservada del ribosoma, lo que subraya su importancia en la función del ribosoma. Como su nombre lo sugiere, esta región es el blanco de las toxinas sarcina y ricina, que son altamente tóxicas para las células. Se sabe que el SRL interactúa con muchos de los factores de traducción de GTPasa como EF-Tu, EF-G, IF-2 y RF-3, pero su función exacta no se comprende completamente.

Un estudio estructural del ribosoma sugiere que el papel del SRL en la traducción es colocar una histidina catalítica en EF-Tu (y presumiblemente otros factores de GTPasa) para la hidrólisis de GTP. [1] Sin embargo, un estudio bioquímico más reciente mostró que el SRL no es esencial para la hidrólisis de GTP. [2] En cambio, su evidencia indica que el SRL está más involucrado en la translocación y la unión de EF-G. En otro artículo, la eliminación de la SRL causó interrupciones importantes en la estructura del ribosoma, lo que sugiere que la SRL se comunica con el núcleo funcional del ribosoma. [3]

  1. RM Voorhees, TM Schmeing, AC Kelley, V. Ramakrishnan. El mecanismo para la activación de la hidrólisis de GTP en el ribosoma. Science, 330 (2010), págs. 835–838.
  2. Xinying Shi, Prashant K. Khade, Karissa Y. Sanbonmatsu, Simpson Joseph, Función funcional del bucle Sarcin-Ricin del 23S rRNA en el ciclo de elongación de la síntesis de proteínas, Journal of Molecular Biology, Volumen 419, Temas 3–4, 8 Junio ​​de 2012, páginas 125-138, ISSN 0022-2836, http://dx.doi.org/10.1016/j.jmb.2012.03.016.
  3. Lancaster L1, Lambert NJ, Maklan EJ, Horan LH, Noller HF. El asa de sarcina-ricina del 23S rRNA es esencial para el ensamblaje del núcleo funcional de la subunidad ribosómica 50S. ARN Oct de 2008; 14 (10): 1999-2012. doi: 10.1261 / rna.1202108. Epub 2008 28 de agosto.

Además de Tim, y para simplificar las cosas, el bucle de sarcina / ricina (SRL) está altamente conservado en el ARN ribosómico 23S. Los ARN ribosómicos (subunidades grandes y pequeñas) comprenden el ribosoma, que es responsable de la síntesis de proteínas. El papel preciso es desconocido. Pero hay evidencias de que SRL tiene una relación mutua con los factores de alargamiento (Tu y G) al protegerse mutuamente de las modificaciones químicas cuando se unen entre sí. Los EF son importantes para los ribosomas para completar la construcción de una proteína estable a partir de cadenas peptídicas. Aún no se ha determinado cómo se protegen entre sí de la modificación química.

Xinying Shi, Prashant K. Khade, Karissa Y. Sanbonmatsu, Simpson Joseph, Función funcional del bucle sarcina-ricina del 23S rRNA en el ciclo de alargamiento de la síntesis de proteínas, Journal of Molecular Biology, Volumen 419, Temas 3–4, 8 Junio ​​de 2012, páginas 125-138.