Sistema es un término muy general que se refiere a cualquier combinación de componentes y procesos que forman un todo coherente. Básicamente, un sistema es cualquier cosa que tenga entrada y salida.
Un sistema biológico puede ser una célula de podredumbre blanca que digiere la madera, una población en crecimiento y migrante, el sistema digestivo o un conjunto de reacciones bioquímicas entrelazadas.
El pensamiento sistémico es la forma holística de trabajar en biología, donde los componentes de un sistema que interactúa se consideran juntos, como un todo. Esto es interesante porque los componentes simples que trabajan juntos a veces pueden dar lugar a patrones inesperados y complejos (comportamiento emergente).
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La biología de sistemas es la rama de la biología que estudia formalmente los sistemas biológicos. En la práctica, esto a menudo se reduce a modelar redes de genes (genes que activan e inhiben la transcripción de cada uno, lo que puede conducir a mecanismos de regulación posiblemente complejos). Pero en términos más generales, la biología de sistemas incluye todos los enfoques biológicos basados en mediciones y razonamientos holísticos. Por lo tanto, la biología de sistemas está estrechamente asociada con los campos * omics, como la genómica (que estudia todo el genoma a la vez, a diferencia de un gen a la vez) y la transcriptómica (que mide y estudia todas las transcripciones de ARNm en una célula juntas).