Origen de la vida: ¿Cuál es alguna evidencia a favor de un mundo de ARN?

La mayor evidencia es que el ARN se autorreplica. El ARN por sí mismo es tanto un genotipo como un fenotipo, capaz de evolucionar. Luego tiene una investigación reciente que muestra que las ribozimas pueden formar redes cooperativas que son mucho más exitosas que las ribozimas individuales [1], lo que demuestra que no solo son capaces de heredar, sino también de cooperar.

Este es un descubrimiento importante porque la otra evidencia para el mundo del ARN es que el ARN es esencial para lubricar la maquinaria celular, tanto con ribozimas como también al hacer proteínas: los ribosomas (los orgánulos que unen aminoácidos para producir proteínas) no son más que ARN con proteínas periféricas [2,3]. En otras palabras, esto permite que el ARN desempeñe un doble papel como portador de información y como fabricante. Agregue una membrana a su alrededor y tendrá una célula muy básica.

Referencia 1 (no se insertará correctamente por alguna razón): http://www.nature.com/nature/jou…

La mejor evidencia es que el ARN es la única molécula que podría hacer todo, desde el almacenamiento de genes hasta la catálisis. En el mundo del ARN, el ARN funcionó como la plataforma para fabricar catalizadores, es decir, ribozimas en lugar de enzimas, que se producen a partir de aminoácidos, es decir, son proteínas. Entonces, el mundo del ARN fue seguido por el mundo de las proteínas cuando se inventó la transformación. No veo ninguna razón para hablar de ningún mundo de ADN. El ADN probablemente se usó para el almacenamiento a largo plazo de información genética bastante temprano en el mundo del ARN. En mi opinión, fue el mundo de las proteínas lo que hizo que los eucariotas completaran su configuración al agregar el citosol fuera del núcleo, que existía en el mundo del ARN. Luego vinieron los orgánulos. Algunos de ellos viajaban, por ejemplo, para alcanzar los metabolitos necesarios, y otros se volvieron tan autónomos que se convirtieron en bacterias cuando su huésped se extinguió. Otros operaban solo localmente. Se convirtieron en mitosomas, hidrogenosomas, mitocondrias y cloroplastos. Los orgánulos más antiguos, con un solo compartimento, son “núcleos basados ​​en ARN, no bacterias”. La teoría del escape de los organelos describe esto aquí:

Conceptos erróneos en las teorías de la evolución.

Ampliando los comentarios de Marc Srour, las proteínas se hacen de esta manera: el ADN se copia en una cadena de ARN (ARN mensajero) y los aminoácidos se agregan a fragmentos de ARN (ARN de transferencia). Se unen en una estructura llamada ribosoma para ensamblar proteínas. Los ribosomas tienen su propio ARN (ARN ribosómico, por supuesto), y su ARN parece ser la parte más importante de ellos.

Los monómeros de ADN (negros de construcción) están hechos de ARN, lo que sugiere que el ADN era un complemento.

Varias de las vitaminas B probablemente se remontan al mundo del ARN, como es evidente por las cositas de ARN que contienen.
Coenzimas como coribozimas. El metabolismo moderno como palimpsesto del mundo del ARN.
B1 (tiamina), B2 (riboflavina), B3 (niacina), B5 (pantotenato), B6 ​​(piridoxal).

Los restantes son B7 (biotina), B9 (folato) y B12 (cobalamina).

La biotina probablemente surgió después de que las proteínas aparecieron, no en el mundo del ARN.

B12 tiene un anillo de porfirina, y las porfirinas probablemente datan del mundo del ARN.

De los lípidos de membrana, los terpenos probablemente datan del mundo del ARN, pero los ácidos grasos solo están presentes en las eubacterias y eucariotas.

Hay que reconocer que el origen del mundo del ARN no está resuelto. Dado que es difícil producir ARN prebióticamente, algunas personas han especulado que descendía de moléculas anteriores como “ácidos nucleicos peptídicos” (con una cadena de proteínas en lugar de una ribosa-fosfato) o “ácidos nucleicos de hidrocarburos aromáticos policíclicos”.

No hay evidencia de un mundo de ARN real, al menos no un mundo de ARN que no sea el producto de un mundo de proteínas en funcionamiento. No hay evidencia, porque no funciona como una teoría de los orígenes, es una historia basada en la idea de una molécula autorreplicante. El autorreplicador más simple es el ARN, por lo que las personas asumieron que debe haber ocurrido espontáneamente. No lo hace.

El ARN es difícil de producir, fuera de la catálisis asistida por proteínas. El ARN tiene un azúcar en su columna vertebral, y el azúcar tiene oxígeno e hidrógeno dispuestos en un patrón COCO con enlaces energéticos, es por eso que es un buen combustible celular. Para hacer este patrón de enlace, necesita algo de magia, una fuente de energía química que pueda extraer oxígeno de su forma estable en CO2, o de su forma elemental en O2, o de las rocas. Los mecanismos se pueden imaginar sin biología, podemos sintetizar ácidos nucleicos, pero cualquiera de estos mecanismos es barroco, implican pasos extraños e inverosímiles.

Una vez que hace la parte de azúcar, debe soldarla al resto de la molécula de ARN, que se produce en un tipo de ambiente químico diferente, y esto significa que una parte está hecha en un ambiente reductor, otra parte en un ambiente ácido, otra parte en la sal, y así sucesivamente, y luego se unen, con chispas e iluminación, y tienes ácidos nucleicos. Puede hacerlo (apenas), pero claramente aparecerá en pequeñas cantidades si es que lo hace. Incluso después de que aparece, no puede polimerizar espontáneamente en una cadena, e incluso si lo hace, ningún ARN puede autocatalizar su propia replicación. Incluso si autocaliza su propia replicación, un ARN autorreplicante solo se come todos los nucleótidos al hacer copias de sí mismo, y llena todo el espacio prebiótico con copias de ARN no deseadas que no evolucionan más. La historia no funciona en todos los niveles. Pero las personas se aferran a él porque no pueden pensar en otra cosa.

Hay algo más, y funciona, pero da vuelta la imagen de la evolución en su cabeza, acercándolo al diseño inteligente (excepto sin ninguna intervención sobrenatural).

A diferencia del ARN, la proteína se produce espontáneamente en muchos entornos, ya que se forma a partir de NH3 (amoníaco), CO2 (dióxido de carbono), CH4 y H2O (agua) en muchas circunstancias naturales. Con el petróleo alrededor (el petróleo está presente en la Tierra antigua, se forma sin biología), puede formar fácilmente péptidos que catalizan la formación de otros péptidos, sin ninguna replicación. Este sistema se completa de manera fácil y plausible en el sentido de Von Neumann, Conway y Wolfram: transforma la información en los polipéptidos que son lo suficientemente complejos como para formar una computadora universal.

Cuando tienes una computadora, el sistema comienza a evolucionar espontáneamente, en el sentido de Darwin, incluso antes de que haya una replicación precisa. La evolución es de los patrones que son estables en presencia de otras proteínas en la sopa. Los péptidos pequeños se digieren o se unen con otros péptidos de una manera que depende de la secuencia, y los polipéptidos ramificados resultantes discriminan entre diferentes péptidos pequeños, y en un entorno propicio para hacer enlaces peptídicos, canalizarán los nuevos péptidos a ciertas formas y lejos de los demás. La clase de formas permitidas se vuelve más y más estrecha con el tiempo, ya que los péptidos actúan entre sí, y esto es automático en cualquier autómata Wolfram de “clase 4”, es solo la evolución temporal natural en el sistema.

La evolución darwiniana tiene competencia, ya que la subparte del autómata completo que puede imponer su orden al resto es la más exitosa. El autómata molecular más exitoso eventualmente aprenderá a formar ARN, como un aparte, a hacer cadenas de él, y usar esas cadenas para producir muchos péptidos de la forma que desea. También aprenderá a replicar el ARN, y eventualmente producir ADN, y almacenar el ARN en el ADN. Todo esto a partir de la evolución molecular que precede a cualquier molécula replicante.

La imagen de que la integridad de Turing es el ingrediente principal de la evolución, y el tipo de supresión inmunológica no autoinmunológica de las moléculas sobre otras. Este tipo de evolución hace que un sistema completo de Turing, una computadora grande, una inteligencia, salga de las moléculas, y solo este tipo de cosas admite la evolución darwiniana.

Si crees que esto suena diferente de lo que está sucediendo hoy en la vida, es solo porque lo que está sucediendo hoy no es lo que se describe en los libros de texto de biología. La evolución cambió hace mucho tiempo para actuar sobre secuencias de ARN y ADN en forma cruda en lugar de proteínas, y la evolución de la secuencia se logra mediante un acto autorizado de reescritura en grandes redes de ARN en óvulos en y en células productoras de esperma. Esta es una predicción, ya que todavía no se observa cómo se escriben las mutaciones en las células de la línea germinal, pero es una predicción segura porque los modelos actuales de evolución replicativa con mutaciones puntuales aleatorias seguramente no funcionarán, ya que se atascan en un mínimo rápido – Por ejemplo, los virus están evolucionando de esta manera, y todos son callejones sin salida.