Una de las limitaciones más significativas para la evolución del ADN es que los genes en un organismo sano ya realizan su función, y cambiar la secuencia de esos genes a menudo interrumpe esas funciones, haciendo que el portador de ese ADN sea menos propenso a transmitir esos genes, y así, para que esos genes aumenten en abundancia dentro de una población. Si la mutación aleatoria nunca resultara en una pérdida de condición física, la evolución y el origen de las especies serían mucho más rápidos.
Del mismo modo, los rasgos a menudo están correlacionados. Lo que eso significa es que la selección para un aumento en algún rasgo, digamos altura en las plantas, daría como resultado una población de plantas con mayor altura, pero quizás también un menor nivel de toxicidad contra los herbívoros. El rasgo de altura y el rasgo de toxicidad se considerarían negativamente correlacionados, lo que significa que sería muy difícil provocar un aumento en ambos al mismo tiempo. En otras palabras, la evolución de mayor toxicidad está limitada por la evolución concurrente hacia una mayor altura.
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