¿Por qué tenemos intrones?

En mi opinión, las respuestas propuestas hasta ahora son bastante buenas, pero me gustaría presentar brevemente el punto de vista de la genética de poblaciones sobre la cuestión.

TL; DR

Los intrones, como dicen Justin Ma y Meghana Sandhya Rastogi, son básicamente ADN basura y no es impactante si se considera la acción de la deriva genética además de la selección natural.

Versión larga

La formulación de la pregunta me suena un poco teleológica: es importante recordar que una estructura biológica dada no tiene que tener una función. Hay muchas cosas inútiles o subóptimas en los seres vivos.

¿Por qué?

Pensar que cada estructura biológica debería tener un propósito generalmente proviene de una confusión entre el proceso de evolución general y lo que se llama selección natural. La selección natural es una de las fuerzas impulsoras de la evolución, y una que a veces tiende a producir estructuras útiles en los seres vivos (“adaptación”).

Pero, como ahora se reconoce, la selección natural no es la única fuerza impulsora de la evolución . Otro muy importante es la deriva genética aleatoria . La deriva es el cambio de frecuencias alélicas durante generaciones debido a errores de muestreo cuando la generación [matemática] n + 1 [/ matemática] se produce a partir de la [matemática] n [/ matemática]. Si lanza una moneda 10 veces, generalmente no tendrá exactamente 5 colas y 5 caras, y sin embargo, la expectativa matemática del número de colas es la mitad del número de intentos. La diferencia entre el resultado observado y el resultado esperado (en un sentido probabilístico) proviene del error de muestreo y disminuirá a medida que aumente el número de intentos. Esto es básicamente de lo que se trata la deriva.

El gran biólogo evolutivo Motoo Kimura, entre otros, ha demostrado matemáticamente que la deriva genética aleatoria puede interferir con la selección natural y 1) evitar la fijación de una mutación beneficiosa o 2) permitir la fijación de una nociva. Puede encontrar los cálculos, por ejemplo, en el siguiente documento:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/…

Los parámetros cruciales para evaluar la importancia relativa de la deriva y la selección son el coeficiente de selección [math] s [/ math], que le indica cuánto beneficio (si [math] s> 0 [/ math]) o perjudicial (if [math] ] s <0 [/ math]) la mutación es para su portador, y el tamaño de la población (efectiva). Para simplificar, olvidemos esta idea del tamaño de la población "efectiva", y consideremos solo el tamaño de la población. Nuestras conclusiones seguirán siendo cualitativamente correctas.

La probabilidad de fijación de un alelo con coeficiente de selección [matemática] s [/ matemática] en una población haploide de tamaño de población [matemática] N [/ matemática] viene dada por:

[matemáticas]
\ displaystyle {p = \ frac {1- \ exp (-2s)} {1- \ exp (-2Ns)}}
[/matemáticas]

si el alelo está inicialmente presente en un solo organismo dentro de la población.

El punto de esta fórmula complicada es: un alelo ligeramente nocivo tendrá una probabilidad distinta de cero de alcanzar la fijación en la población, especialmente si el tamaño de la población es bajo. Esto se debe a que una población pequeña es más sensible a la deriva; la deriva es, como dije, un efecto de muestreo de tamaño finito.

Significa que deberíamos esperar observar estructuras biológicas subóptimas en especies con tamaños de población típicamente bajos, porque la selección no fue lo suficientemente efectiva como para eliminarlas.

Ahora hablemos de intrones. Es posible que sepa que los intrones definitivamente no están muy extendidos entre las Eubacterias y las Arqueas (mi maestro de secundaria nos dijo: no hay intrones en las Eubacterias, pero lo fantástico de la biología es que casi todas las afirmaciones como esta parecen tener excepciones, así que yo ‘ Estoy bastante seguro de que puedes encontrar Eubacterias y / o Archaea con intrones, pero sigamos adelante).

* Eubacterias: grandes tamaños de población, ~ sin intrones
* Eucariotas unicelulares (p. Ej., Levadura): que yo sepa, tamaños de población altos, pocos o pocos intrones.
* Eucariotas multicelulares (p. Ej., Nosotros): poblaciones pequeñas (en comparación con bacterias), muchos intrones

¿Ves el patrón (demasiado simplificado, lo sé) aquí?

Al principio es sorprendente que pueda haber estructuras inútiles en los seres vivos, pero la genética de la población sugiere que en realidad se esperan, especialmente en una especie como la nuestra. El razonamiento anterior explica por qué no es realmente sorprendente que una cantidad tan grande de ADN en el genoma humano parezca ser “basura”, y también por qué no debería ser un problema considerar que los intrones son básicamente sin propósito.

Esto no impide que algunos intrones, de vez en cuando, ganen una función y parezcan tener un papel real, ya que hay muchos casos documentados mencionados por Christine Condo, Eric Vene y otros. Pero la función tiene que ser probada y no asumida.

Mi explicación (bastante enrevesada) fue una simplificación tentativa de las ideas de biólogos como Michael Lynch, quien las desarrolla en su libro The Origins of Genome Architecture . Aunque controvertido, creo que tienen mucho sentido.
También pido disculpas a los expertos en biología: sé que he simplificado mucho la situación y que, como es habitual en biología, las cosas son más complicadas que eso.

EDITAR: errores tipográficos

He puesto esto en otras respuestas, pero creo que también es útil aquí. Si no hay ningún mecanismo o selección para que NO los tengamos, y son o podrían derivarse de la replicación de bestias (es decir, si los intrones mismos ‘saben cómo’ ser copiados y transmitidos de generación en generación) entonces tendremos intrones porque no tiene forma de NO tener intrones.

Por supuesto, la evolución es continua y dinámica, algo que se introdujo en nuestro genoma porque PODRÍA sin embargo dar lugar a aspectos útiles, como oportunidades para la regulación o la combinación de exones, o como un medio para generar múltiples versiones variantes de una proteína a partir de un gen único

Es concebible que una razón por la cual las bacterias como E. coli tienden a no tener intrones es porque esos organismos compiten entre sí parcialmente en la velocidad de replicación, y agregar secuencias adicionales no útiles que deben copiarse cada vez que el organismo se divide podría ser selectivo desventaja.

Parece que no estamos compitiendo en el nivel de eficiencia celular, al menos no en el mismo nivel.

Como respuesta breve, enumeraré algunas características importantes sobre los intrones. Hay muchos más, estoy seguro, pero estos me vienen a la mente.

Los intrones permiten productos de empalme alternativos. Esto significa que puede obtener diferentes productos genéticos del mismo conjunto de exones, lo que permite una complejidad aún mayor.

Los intrones pueden contener microARN. Estos pequeños individuos son muy importantes en la regulación postranscripcional de grandes cantidades de genes.

Los intrones pueden ser sitios de unión para proteínas potenciadoras u otras proteínas involucradas en la regulación transcripcional.

Eso es todo lo que se me ocurre en este momento. Estoy seguro de que otros pueden encontrar más formas en que los intrones controlan la expresión génica.

Para empezar, hay más proteínas codificadas por el genoma humano que genes humanos.

¿Por qué?

Esto se debe a que algunos de los genes pueden codificar múltiples protiens diferentes. Los gends contienen intrones y exones, y el exón para un protien puede ser un intrón para otro protien.

Toma este gen hipotético por un momento

Secuencia A -Secuencia B – Secuencia C -Secuencia D

Ahora, dependiendo de qué genes estén activados o qué señal reciba la célula, puede codificar los siguientes protiens:

A B C D

A B C

Y

ACD

discos compactos

BCD

BD

re

Y así sucesivamente, con muchas posibilidades de qué tipo de protien haces, y por ejemplo, la secuencia A es un exón en los primeros 4 protiens y un exón en los demás.

Espero que tenga sentido…

“El intrón de un protien es el exón de otro protien”

La interacción intrón / exón es una fuente importante de variabilidad en la expresión génica. Esto ya se ha abordado, por lo que no voy a dar más detalles.

Los experimentos en levadura han demostrado que agregar intrones artificialmente puede aumentar los niveles de transcripción de genes porque pueden ayudar a reclutar factores que promueven la transcripción. La eliminación artificial de intrones también ha demostrado reducir los niveles de expresión génica.

También hay alguna evidencia de que la presencia de intrones puede ayudar al momento de la expresión de ciertos genes. El gen de la distrofina en humanos es un gen enorme que tiene más del 99% de secuencia intrónica. La transcripción completa demora aproximadamente 16 horas. En el desarrollo del tejido muscular de los embriones, las células pueden replicarse más rápido de lo que se puede transcribir el gen de la distrofina, por lo que no se expresa completamente hasta que el tejido del músculo esquelético alcanza un estado más maduro.

La respuesta de la Sra. Rastogi es correcta, pero solo parcialmente. Introns contienen información reglamentaria. Sin embargo, no son ADN y no son basura; El término “basura” se utiliza para describir la gran cantidad de ADN que no parece servir para ningún propósito de codificación o regulación (aunque los científicos aún pueden descubrir lo contrario).

Primero, los intrones no deben confundirse con los UTR (regiones no traducidas), que contienen promotores e instrucciones de traducción, incluido dónde se traduce un ARNm y durante cuánto tiempo. Los intrones se separan de la región de codificación de ARNm antes de que se traduzca el ARNm, por lo que no serían de mucha utilidad para ese tipo de cosas. Los UTR se encuentran fuera de las regiones de codificación de ARNm y siguen formando parte de la transcripción del ARNm.

Además, “intrón” no es una designación permanente. Algunos pre-ARNm pueden empalmarse de diferentes maneras dependiendo de las necesidades y / o etapa de desarrollo de un organismo. Por lo tanto, un intrón en un ARNm podría ser un exón en otro ARNm transcrito de la misma región de codificación de ADN, y viceversa.

Hay múltiples funciones para intrones, pero solo daré un par de ejemplos.

El ARN nucleolar pequeño puede codificarse en algunos intrones. Este ARN es necesario para modificar otras moléculas de ARN.

Los intrones también permiten el empalme alternativo de proteínas. Un ejemplo es en la Tropomiosina, donde diferentes tipos de células empalmarán el gen de diferentes maneras. Esto puede conducir a una mayor diversidad dentro del proteosoma y permite que diferentes células regulen la misma proteína usando diferentes mecanismos.

La mayoría de las secuencias intrónicas son basura. Es solo un subproducto natural de la evolución del genoma (es decir, mutación).

El tamaño promedio del intrón en humanos es de 1.5 kb, con solo los 150 nucleótidos en cada extremo bien conservados. Cuando son funcionales, están involucrados en empalmes alternativos (diversos productos proteicos), así como en la regulación.

El caso del ADN basura

Los intrones probablemente tienen roles reguladores en algunos casos. En otros, los intrones empalmados pueden variarse, lo que permite que se forme más de una proteína a partir de un solo gen. (Investigación de empalmes alternativos).
En otros casos, los intrones pueden ser fragmentos viejos de ADN viral. Esto es menos útil si por supuesto.

Los intrones son partes del ADN que no codifican una proteína. Se llamaron ADN basura hasta hace poco. Ahora se sabe que desempeñan algunas funciones reguladoras. Su función, sin embargo, sigue siendo en gran medida un misterio. Algunas teorías dicen que son partes del ADN que se volvieron redundantes a lo largo de la evolución.

los intrones son en realidad ADN basura, cierto que no codifican ninguna proteína, pero son necesarios porque son útiles en el análisis filogenético (estudios evolutivos). aparte de eso, algunas secuencias promotoras y reguladoras también están presentes en los intrones.

Investigaciones recientes han encontrado que los intrones regulan la expresión génica. Se transcriben en cadenas de ARN que pueden activar o desactivar genes específicos, lo cual es vital para la función celular. Desempeñan un papel importante en el desarrollo del cáncer.

Los intrones también tienen una función en el ADN. Necesitas algún tipo de separación entre genes y promotores. Muchas veces necesita suficiente longitud para que el ADN se doble a la proteína y la contacte en dos sitios … en este caso es básicamente un “alargador” del ADN.

No creo que tengamos la respuesta completa todavía. Sin embargo, una ventaja valiosa es que permiten un empalme alternativo de ARNm, lo que significa que podemos producir varias proteínas diferentes a partir de un solo gen (aunque es posible que necesitemos repensar la definición aquí).

Los intrones juegan un papel regulador en cierta medida, pero en su mayoría son basura.