Los restos físicos del esqueleto forman la mayor parte de la información que los científicos usan como base para la agrupación de nuestros antepasados. Aparte de la evaluación de la edad de los fósiles, los siguientes son ejemplos de factores que los científicos consideran al asignándoles un taxones (grupo) de diferenciación:
Tamaño del cráneo : indica el tamaño del cerebro que, a su vez, sugiere cuán avanzada era la complejidad de los sistemas culturales y sociales.
Dientes / Mandíbula : el tamaño y el tipo pueden indicar el tipo de alimentos consumidos. Por ejemplo, se pueden ver diferencias para aquellos antepasados que viven de alimentos crudos o cocidos con el uso eventual del fuego.
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Tamaño y postura del marco del esqueleto : el esqueleto puede indicar qué tan erguido y grande era el individuo.
Es importante recordar que la taxonomía, el arte de agrupar y ordenar seres similares, fue diseñada por humanos para ayudar en la clasificación y no se correlaciona directamente con eventos evolutivos reales ya que, por su propia naturaleza, la evolución es un cambio gradual y constante en el gen frecuencias (que culmina en los restos físicos que vemos), y no forma espontáneamente grupos únicas de los individuos de una generación a la siguiente. Debido a esto, las “líneas trazadas” por los científicos son imperfectas e incluso a veces pueden considerarse arbitrarias.