Una teoría es una explicación que se ha corroborado repetidamente a través del método científico, que se apoya en la observación, la experimentación y sigue siendo constante con otros modelos corroborados.
Primero, la evolución misma es un hecho, no una teoría [Elegí este ejemplo en base a los temas seleccionados por el autor de la pregunta]. Es observable El mecanismo que explica estos fenómenos son las teorías de la evolución, una de las cuales es la selección natural. Hay otros que permanecen bien apoyados y constitentes, como la deriva genética.
En segundo lugar, existen hipótesis dentro de la teoría evolutiva que son controvertidas y, en ocasiones, modificadas. Un ejemplo ha sido dónde colocar exactamente la lamprea y el pez bruja en el árbol de la vida. Pero este tipo de inconsistencias no invalidan la evolución. Significa que todavía estamos recopilando evidencia para construir una mejor imagen.
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Tercero, una teoría nunca se prueba. Algunos aspectos a veces necesitan modificación. Con el tiempo, más evidencia y apoyo experimental a favor de la teoría fortalecen la teoría. La evolución continúa siendo apoyada por evidencia experimental. Si, por ejemplo, se encontrase una forma de vida muy compleja en estratos donde debería haber solo formas de vida tempranas, esto sería una gran inconsistencia. Esto nunca se ha encontrado.
Por último, la evidencia misma se toma como un hecho. Estas observaciones repetibles son lo que los científicos quieren decir cuando dicen que algo es un hecho. Las hipótesis y teorías no son hechos, sino explicaciones de hechos.