Además de ser más pequeños, sus plásmidos son formas circulares superenrolladas.
Con el superenrollado, imagine que corta una hebra en una sola ubicación y luego gira la hebra mellada alrededor de la hebra unificada de 10 a 20 veces. Ahora pegue la muesca, la estructura resultante será retorcida y compacta, de forma muy parecida a una goma elástica si la retuerce con fuerza.
Esos plásmidos superenrollados serán estructuras mucho más compactas en comparación con piezas genómicas grandes y flexibles, y resistirán mucho más el corte. Entonces, el pipeteo violento les hará poco daño. El ADN genómico grande se cortará por pipeteo, generalmente hasta 50 kb o menos con puntas estándar.
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Sin embargo, si su próximo paso no necesita ADN grande, como la PCR de amplicones de 200 pb, toda esa atención no tiene sentido. Por el contrario, si desea clonar inserciones de 100 kb para hacer una biblioteca BAC, debe tener mucho cuidado. Es por eso que las muestras para la secuenciación Illumina se pueden purificar en columnas, pero si desea leer detenidamente las secuencias de Pacific Biosviences o Oxford Nanopore, tenga mucho cuidado.
