Cómo simular enlaces atómicos

Supongo que quieres hacer esto a nivel cuántico. Si ese es el caso, la ecuación gobernante relevante para los sistemas cuánticos es la ecuación de Schrödinger:

[matemáticas] \ frac {- \ hbar ^ 2} {2 \ mu} \ nabla ^ 2 \ psi (r) + V (r) \ psi (r) = E \ psi (r) [/ matemáticas]

Esta ecuación se resuelve fácilmente analíticamente para un átomo de hidrógeno (ecuación de Schrodinger de hidrógeno) si utilizamos la aproximación de Born-Oppenheimer. Sin embargo, cuando hay dos o más electrones, una solución analítica se vuelve intratable, por lo tanto, tenemos que recurrir a métodos numéricos para resolver la ecuación. Puedo dar dos métodos alternativos para resolver esta ecuación.

Hartree-Fock

El método más directo para resolver la ecuación de Schrodinger para un sistema atómico arbitrario es el método de Hartree-Fock. Esto utiliza una metodología de conjetura y verificación autoconsistente para converger lentamente a la solución.

Diagrama de flujo de la lógica para Hartree-Fock (del método Hartree-Fock – Wikipedia )

A continuación se muestra un video que presenta una introducción general al método Hartree-Fock con Matlab:

Hartree Fock Video 1.0: Introducción a Hartree Fock con Matlab

Teoría funcional de la densidad

Una alternativa al método Hartree-Fock es la teoría funcional de la densidad. Este es un método común que es mucho más eficiente computacionalmente que Hartree-Fock.

Diagrama de flujo de la lógica para un cálculo de la Teoría funcional de la densidad (DFT) (de la Teoría funcional de la densidad )

Para aprender esto, recomendaría los siguientes recursos:

Código DFT en una hora con Matlab – Parte 1: El átomo de hidrógeno con diferencia finita

También el curso práctico de DFT impartido por el Dr. Tomas Arias es un gran recurso:

Página del curso con recursos: mini curso práctico de DFT

Videos de YouTube del curso:

DFT práctico – Día 1 – Parte 1

¿Por qué reinventar la rueda? Existen muchos programas que pueden simular átomos, enlaces, moléculas y conjuntos de moléculas con diferentes niveles de aproximación que son adecuados para necesidades específicas. Las simulaciones van desde el tratamiento de átomos y enlaces como simples partículas clásicas y osciladores armónicos hasta muchas formas sofisticadas y computacionalmente costosas de resolver la ecuación de Schrodinger en diferentes niveles de aproximaciones.

More Interesting

¿Cómo puede un átomo tener una masa diferente? ¿No lo hace inestable?

Si los átomos, las estrellas y las personas son propiedades emergentes de nuestro universo en evolución, ¿podemos predecir si sucederán más maravillas en el futuro?

Todos nuestros libros de texto dicen: "la partícula más pequeña en la que se puede dividir el elemento carbono es un átomo de carbono". Qué significa eso?

¿Cuál es la velocidad de transferencia de fuerza entre átomos o moléculas?

¿Qué tan cerca tienen que estar un átomo de materia ordinaria (es decir, protón) y un átomo de antimateria (es decir, positrón) antes de aniquilarse entre sí?

¿Qué pasaría si cada átomo de uranio y plutonio en la Tierra se sometiera a fisión de una vez?

¿Qué pasaría si alguien juntara cantidades iguales de cada átomo conocido por el hombre y lo bombardeara con presión, calor y todo tipo de onda?

¿La célula humana está hecha de un átomo?

¿Qué pasa si somos, para un ser mayor, qué átomos, protones, electrones, neutrones y quarks son para nosotros?

¿Qué determina el coeficiente de un orbital atómico de un átomo en una molécula como la acroleína?

Se confirmó una nueva forma de núcleos atómicos en forma de pera, lo que sugiere que el viaje en el tiempo es imposible. ¿Qué podría desacreditar esta declaración?

¿Hay alguna manera de que podamos ver los átomos?

¿Qué son los depósitos, subcapas y orbitales en un átomo? ¿Cuál es la relación entre ellos? ¿Qué es lo que parecen?

¿Qué sucede a escala atómica cuando se refleja la luz?

¿Por qué es más fácil eliminar electrones de la subcapa de 4 s en lugar de la subcapa de 3 d?