¿Por qué los fragmentos de ADN se separan en bandas?

El ADN se ordena por tamaño en bandas.

Supongo que está hablando de una prueba como la electroforesis en gel, después de un proceso de amplificación como la PCR.

El ADN puede cortarse con enzimas de restricción, o simplemente hibridarse con cebadores de ADN, pero se crean fragmentos para alguna sección deseada de ADN y se “amplifican” mediante reacciones en cadena de la polimerasa (PCR). La PCR es un proceso cíclico que utiliza ciertas sustancias químicas y temperaturas que hace que los fragmentos de ADN se repliquen una y otra vez.

Después de la amplificación, los fragmentos de ADN se colocan en los pocillos en un gel hecho de agarosa, en un baño, y se aplica un voltaje. El ADN está cargado negativamente, por lo que los fragmentos de ADN intentan viajar a través del gel hacia el electrodo positivo. Ya sea antes o después de la electroforesis, el ADN se tiñe para que pueda verse dentro del gel.

Un grupo de fragmentos de ADN teñidos forma una banda. Pero el ADN resiste viajar a través del gel, y segmentos más grandes de ADN resisten viajar más. Si los fragmentos de ADN son de diferentes tamaños, los fragmentos más pequeños viajan más rápido y más lejos a través del gel. Entonces, los fragmentos de ADN de diferentes tamaños forman diferentes bandas, cada banda corresponde a un tamaño de fragmento de ADN.

Según los cebadores de ADN o las enzimas de restricción que se usaron originalmente para fabricar las piezas de ADN, algunas secciones de ADN tendrán variaciones de tamaño, dependiendo de cosas como:

  • Inserciones de ADN dentro del segmento de ADN
  • Variaciones en el número de repeticiones de ADN
  • Variaciones en secuencias de ADN particulares (que son cortadas por las enzimas de restricción o no, dependiendo de la variación en los nucleótidos de ADN)

Al final, obtienes varias bandas de fragmentos de ADN teñidos (una banda para cada tamaño), que se interpretan en función de cómo se hicieron los fragmentos.

Este ejemplo es una prueba de la inserción PV92 Alu en el cromosoma 16. Algunas personas tienen una inserción adicional de 300 pb (“Alu”) en el cromosoma 16 (“+”). Algunas personas no (“-“). Algunas personas tienen ambas variaciones (“+/-“).

Las tres columnas de la izquierda son marcadores de prueba con resultados conocidos. Las columnas marcadas con 1 y 2 son dos personas. La persona 1 es homocigota – / -. La persona 2 es heterocigota +/-.

Supongo que te estás refiriendo a algo como este gel de SDS PAGE:

De hecho, la explicación es muy simple. En la electroforesis en gel de poliacrilamida, el experimentador vierte una solución de gel en una bandeja y espera a que se enfríe, dejando una torta de goma rígida en la bandeja. El gel está compuesto por una matriz de poliacrilamida y una solución de agua y electrolitos. El experimentador usa un peine de plástico sumergido en el gel para dejar agujeros (pozos) en los que rocían el ADN.

El gel es como un tamiz, lleno de poros por todas partes. Cuando se pasa una corriente eléctrica a través del gel, la cadena principal de azúcar-fosfato cargada negativamente en el ADN se dirige hacia el extremo de la bandeja con carga positiva. La rapidez con que se extrae el ADN a través del gel depende de la longitud del fragmento de ADN. Las piezas más grandes son más difíciles de colocar a través de los poros en el gel que los fragmentos más pequeños, por lo que los fragmentos más pequeños se mueven más rápido. El resultado práctico es que el ADN está separado por longitud en bandas de igual longitud.

En al menos el 30% de los casos de infertilidad masculina, la verdadera causa de infertilidad sigue siendo desconocida. La única forma de evaluar la fertilidad masculina se limitó al análisis de esperma. Una nueva investigación científica sugiere que el grado de fragmentación del ADN en los espermatozoides es un factor predictivo para la fertilidad masculina. Visite este artículo para saber más: Índice de fragmentación del ADN espermático | Blog de Cloudnine #CloudnineHospitals