Si se sospecha que las mitocondrias generadoras de energía se han convertido en parte de las células animales a través de la simbiosis, ¿cómo se han convertido en “una especie” con su animal subsumidor?

Las respuestas aquí son suficientes para resolver la pregunta básica, pero también debe tener en cuenta que la evolución de las mitocondrias ocurrió unos mil millones de años o más antes de la evolución de los animales, y las mitocondrias son una característica definitoria de todos los eucariotas. Además, puede interesarle saber que la endosimbiosis es un desarrollo que ha ocurrido más de una vez en la historia posterior de eucariotas (aunque no en animales).

Los cloroplastos son los orgánulos esenciales para la fotosíntesis en las plantas, y se derivan de una cianobacteria. A partir de este evento original de endosimbiosis, no solo evolucionaron las plantas y los cloroplastos, sino también la gama de organismos y sus orgánulos que puede ver en la imagen a continuación. Los cloroplastos son solo un ejemplo del tipo de orgánulo llamado plastidio. Al igual que las mitocondrias, estos orgánulos vienen con sus propios genomas circulares.

Puede ver en el diagrama que los eucariotas se han tomado en otros momentos otros eucariotas y les han robado sus plastidios o los han convertido en plastidios: endosimbiosis secundaria. También se muestra endosimbiosis terciaria.
Este artículo es un gran resumen en profundidad de toda la historia de los plastidios: el origen endosimbiótico, la diversificación y el destino de los plastidios (donde se origina este diagrama). ¡Ciertamente aturde la mente!
En el centro, se puede ver otra endosimbiosis primaria recientemente ocurrida en Paulinella: una eucariota que toma una procariota como endosimbionte.

Las mitocondrias tienen ADN separado. Cada huevo tiene muchas mitocondrias, cada uno con su propio ADN, y eso pasa al nuevo animal cuando el huevo es fertilizado.

En realidad, no sería tan irracional considerar que todavía son organismos simbióticos y una especie separada del huésped. Pero debido a que la única forma en que pueden transmitir sus genes más allá de la muerte del huésped, es pasarlos a la descendencia del huésped … efectivamente están encerrados en la especie huésped de una manera que la mayoría de las especies simbióticas (como las bacterias intestinales) no son.

El punto es que qué es un organismo y qué es un orgánulo puede ser muy confuso.

Aunque las mitocondrias retienen material genético heredado y el aparato transcripcional para producir proteínas a partir de él, en realidad esto todavía se usa solo para unas pocas de las proteínas mitocondriales. La mayoría se subcontrató hace mucho tiempo a la célula huésped y la proteína terminada se importa a través de la pared mitocondrial. El mecanismo probablemente fue a través de un virus que copiaba un gen de ADNmt en el genoma nuclear donde se expresaba, luego las mitocondrias mutantes no se molestaban en hacer que esa proteína tuviera una ventaja selectiva y ganara a los que aún lo hacían.

Parte de la información para las mitocondrias se encuentra dentro del ADN mitocondrial. Más está en el genoma de las células huésped. Cómo llegó allí es una buena pregunta. Quizás partes de él se recombinaron e integraron.