Las escaleras de ADN son muy útiles y fáciles de conseguir. Los usamos principalmente en electroforesis en gel para determinar el tamaño y la cantidad de ADN.
Podemos poner el ADN que estamos probando y determinar el tamaño relativo dependiendo de qué tan lejos se mueva a través del gel durante un cierto período de tiempo. Cuanto más grande sea el hilo, más lento se moverá a través del gel. Por el contrario, cuanto más pequeño sea el hilo, más rápido se moverá a través del gel. Esto se puede aplicar a todo tipo de macromoléculas además del ADN también.
La cantidad también se puede determinar examinando qué tan oscura es una determinada línea de la escalera. Cuanto más oscura es la línea, más está presente.
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Básicamente, es una forma rápida y fácil de determinar cuántos pares de bases hay en un determinado fragmento de ADN, así como cuántos fragmentos hay.