De wikipedia:
El color de los ojos es un carácter fenotípico poligénico y está determinado por la cantidad y el tipo de pigmentos en el iris del ojo.
En los ojos humanos, las variaciones en el color se atribuyen a las proporciones variables de eumelanina producidas por los melanocitos en el iris. Los ojos de colores brillantes de muchas especies de aves están determinados en gran medida por otros pigmentos, como pteridinas, purinas y carotenoides.
Tres elementos principales dentro del iris contribuyen a su color: el contenido de melanina del epitelio pigmentario del iris, el contenido de melanina dentro del estroma del iris y la densidad celular del estroma del iris. En ojos de todos los colores, el epitelio pigmentario del iris contiene el pigmento negro, la eumelanina. Las variaciones de color entre diferentes irides se atribuyen típicamente al contenido de melanina dentro del estroma del iris. La densidad de las células dentro del estroma afecta la cantidad de luz que absorbe el epitelio pigmentario subyacente.
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