¿Han estado los animales bajo observación el tiempo suficiente para detectar el aumento de mutaciones beneficiosas? Recuerda que tienen que ocurrir. Los cambios ambientales determinarán si duran.

Sí, se han observado muchas mutaciones beneficiosas en animales y plantas.

Hay varias mutaciones en el gen daf-2 en un nematodo (Caenorhabditis elegans) que las hace vivir más tiempo (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc…). Pero eso es para los nematodos que viven en condiciones de laboratorio. Es mejor mirar un animal que vive en la naturaleza.

Si los humanos, que vivían en el pasado, cuentan como animales, entonces se han detectado muchas mutaciones beneficiosas. La evidencia de eso es indirecta, se basa en algo llamado desequilibrio de ligamiento .

Así es como funciona eso. Imagine una población con genes variados. La imagen de la izquierda muestra un cromosoma con algunos genes para varias personas. Imagine que ocurre una mutación; ese es el gen estrella en la tabla central. Si la mutación es beneficiosa, se volverá más común con el tiempo, como se muestra en la imagen de la derecha. Observe que el gen amarillo fue arrastrado junto con el gen beneficioso, mientras que el gen azul no. Eso sucede porque casi todos los que heredan la mutación también tienen genes cerca. Los genetistas usan la expresión barrido selectivo para describir ese proceso evolutivo.

Ese fenómeno se llama desequilibrio de ligamiento. Los genetistas pueden observar los genes humanos y verificar los genes que ocurren juntos más a menudo que por casualidad. Puede obtener una explicación más completa aquí: ¡Es un barrido (selectivo) para los buenos genes!

Un ejemplo de barrido selectivo es el gen AMY1 que afecta la capacidad de digerir el almidón (https://www.nature.com/articles/…). Esta mutación particular afecta el número de copias de ese gen.

Varios genes que afectan la capacidad de digerir la leche también siguen ese patrón.

Hay muchos otros genes que muestran un desequilibrio de enlace que solo podría haber ocurrido debido a mutaciones. En muchos casos, los científicos no saben qué ventaja confiere el gen a pesar de que hay dudas de que el gen sea beneficioso.

Puedes leer discusiones técnicas aquí:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc…

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc…

Claro que sí. Un ejemplo clásico; La polilla moteada en el Reino Unido. Esto es típicamente una polilla blanca, pero a medida que el hollín y el humo del carbón ennegrecían los árboles de la Inglaterra industrial a fines del siglo XIX, floreció una variante oscura y rara, que suplantó rápidamente a sus pares blancos comunes al mezclarse con la corteza de árbol recién oscurecida. En la década de 1950, el 90% de todas las polillas salpicadas en la región cerca de Manchester eran oscuras, no blancas. Cuando la calidad del aire comenzó a mejorar en la década de 1970, las polillas blancas regresaron; hoy, constituyen más del 90% de la población.

Sí, podemos detectar tales mutaciones en animales, como se señala en otras respuestas. También tenemos el famoso “Experimento de evolución a largo plazo”, que tiene casi 70,000 generaciones de e.coli de un grupo inicial original de doce poblaciones separadas pero idénticas [1].
Se toman muestras cada 500 generaciones; esas muestras de generaciones anteriores se enfrentan a muestras posteriores para medir los cambios en la aptitud. Si está tratando de obtener una medición de la evolución y los genes, esta es la fuente de datos más rica que tenemos, donde podemos comparar población contra población, a partir de muestras idénticas, en condiciones idénticas.
No podemos hacer nada así para especies más grandes que se reproducen más lentamente, pero con las nuevas tecnologías de ADN podemos mirar hacia atrás en el tiempo e inferir el momento en que ocurrieron las mutaciones y cómo se diseminaron bajo presión selectiva.

Notas al pie

[1] Uno de los más grandes experimentos de evolución ha seguido 68,000 generaciones de bacterias

Sí, por ejemplo, las ratas que viven alrededor de las unidades de refrigeración desarrollan pelaje más largo. Sin embargo, es más fácil de detectar con bacterias, porque se reproducen y, por lo tanto, evolucionan mucho más rápido que los animales. Aquí hay un poco de película

mostrando bacterias que se adaptan a nuevas condiciones en cuestión de horas o días.