La base de datos TIGER (Expresión y regulación de genes específicos de tejidos) muestra la expresión por tejido y tiene conjuntos de datos descargables (Descargar archivos).
No sé nada sobre la fiabilidad de estos conjuntos de datos. Sin una razón particular para ello, tengo un vago escepticismo sobre todo el concepto.
EDITAR para mencionar este artículo reciente
Combinando evidencia de relaciones preferenciales de tejidos genéticos de múltiples fuentes
lo cual puede ser útil:
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Aunque varias fuentes de datos y métodos se han publicado explícitamente para este propósito, a menudo no están de acuerdo y no es evidente cómo recuperar estos genes y cómo distinguir los hallazgos biológicos verdaderos de los que se deben a la elección del método y / o la configuración experimental. . En este trabajo, hemos desarrollado un enfoque computacional que combina resultados de múltiples métodos y conjuntos de datos con el objetivo de eliminar sesgos específicos del método / estudio y mejorar la previsibilidad de los genes humanos expresados preferencialmente. … Comparamos los genes de las puntuaciones más altas con las bases de datos públicas: PaGenBase (microarray), TiGER (EST) y HPA (datos de expresión de proteínas). Los resultados tienen un 85% de superposición a PaGenBase, un 71% a TiGER y solo un 28% a HPA. El 99% de nuestras predicciones tienen soporte de al menos una de estas bases de datos. Nuestro enfoque también funciona mejor que cualquiera de las bases de datos para identificar objetivos de medicamentos y biomarcadores con especificidad de tejido conocida.
