En el pasado, los científicos se acercarían a la región general donde residen sus genes de interés y caminarían por los cromosomas para encontrar exactamente dónde está el gen.
No viví en esa época, pero lo aprendí durante mi licenciatura 2003–2006. Pero por lo que parece, es bastante tedioso.
Durante la era de la genómica temprana, se analizaron los ADNc, en forma de EST (etiquetas de secuencia expresada) y se predijo la secuencia de codificación putativa de los genes. Tenía la impresión de que este procedimiento relativamente simple + computacionalmente automatizado era lo suficientemente bueno como para predecir correctamente muchas proteínas de las transcripciones.
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Dos formas principales en que los científicos investigan la función de un gen es a través de experimentos de sobreexpresión (ganancia de función) y derribo o pérdida de función (pérdida de función). Después de introducir / interrumpir el gen de interés, el científico observará el nuevo fenotipo.
La sobreexpresión se realiza típicamente a partir de plásmidos de expresión o vectores virales en ensayos in vitro, o mediante knock en ratones.
Knockdown típicamente hecho usando siRNA.
La eliminación previa se realizó principalmente mediante recombinación genética para alterar el gen de interés. En la actualidad, casi todos usan CRISPR / Cas9.