¿Por qué la ARN polimerasa tiene que unirse a una secuencia de consenso aguas arriba en lugar del promotor directamente?

¿Es esta una pregunta capciosa de algún tipo? Supongo que por aguas arriba su referencia es TSS.

El promotor NO es un elemento único / pequeño . Por lo general, consta de regiones centrales, proximales y distales, y alberga secuencias de consenso utilizadas para unir diferentes factores / proteínas. Los espaciadores y las secuencias de consenso son parte esencial del promotor. Entonces, en ese sentido, ¡esta pregunta es muy vaga!

El ARNp se une al consenso DENTRO de la región promotora (ejemplos comunes son cajas pribnow o Goldberg). Los espaciadores entre los elementos de unión ayudan en el reclutamiento específico de proteínas (hay proteínas que prefieren 10 espaciadores básicos y hay proteínas que prefieren 11 espaciadores básicos).

El reclutamiento / reconocimiento de RNAp varía en procariotas y eucariotas. Ejemplo: en procariotas, el factor sigma ayuda al reconocimiento del promotor y al reclutamiento de RNAp en el sitio del promotor para iniciar la transcripción. En eucariotas hay un proceso diferente de reclutamiento (plétora de TF y sin Sigma). Antes del promotor, generalmente en los elementos distales, se encuentran los sitios reguladores (como los potenciadores), que regulan la velocidad / actividad de la transcripción.