Un proyecto simple que usa BLAST y la filogenia es “simplemente” construir un árbol filogenético usando BLAST para desarrollar una asociación entre especies o géneros de ADN, ARN o secuencias de proteínas disponibles.
Permítanme aclarar un poco: los árboles de filogenia son estructuras en forma de árbol que representan asociaciones entre algo. Esto significa que hay algún tipo de métrica o cálculo para determinar las asociaciones entre los extremos del árbol. Por ejemplo, un número que demuestra cuán estrechamente relacionados están una manzana y una naranja con un mouse. Este número puede calcularse mediante una lista de preguntas como “¿son ambas frutas?” Y resumir todas las respuestas. Otro podría ser observar las secuencias genómicas y destruir un gen particular entre los tres y basarse en lo que tiene la construcción más similar del árbol de esta manera.
Árbol filogenético
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