No entendí tu pregunta muy bien. Existen múltiples formas de obtener secuencias de ADN y ARN, por ejemplo, utilizando la reacción de la polimerasa de la barbilla o la reacción en cadena de la ligasa. Estos métodos le indican la secuencia de nucleótidos que forman el ADN o el ARN, pero no le informan sobre la funcionalidad de esas secuencias. El método FISH (Fluorescence in Situ Hybridization) nos informa sobre la presencia de secuencias específicas y sus números en una muestra de ADN, siempre que sepamos de antemano qué secuencia estamos buscando. El método de huellas dactilares de ADN nos ayuda a descubrir cuán estrechamente se unen dos secuencias de ADN entre sí, pero no nos informan sobre las secuencias específicas.
Existe un método indirecto para estudiar las secuencias de ADN y ARN y es estudiar la secuencia de aminoácidos de la estructura primaria de las proteínas. La regla es que cada aminoácido está codificado por un conjunto de tres nucleótidos llamado codón. Cada codón codifica un aminoácido específico, pero un único aminoácido puede codificarse por múltiples codones. Como ya conocemos los codones para los aminoácidos que son casi universales, podemos volver a calcular. Como el ARN se crea de forma complementaria al ADN, también podemos predecir la secuencia de ARN. Sin embargo, esto solo nos informa sobre la porción exónica o codificante del ADN / ARN. Le sugiero que estudie el Proyecto Genoma Humano para obtener más información sobre los métodos involucrados en la secuenciación.
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